Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0U3

Tmem17, Transmembrane protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem17Q8K0U3 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmem17Q8K0U3 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmem17Q8K0U3 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmem17Q8K0U3 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmem17Q8K0U3 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmem17Q8K0U3 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmem17Q8K0U3 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmem17Q8K0U3 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tmem17Q8K0U3 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tmem17Q8K0U3 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tmem17Q8K0U3 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tmem17Q8K0U3 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tmem17Q8K0U3 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tmem17Q8K0U3 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tmem17Q8K0U3 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tmem17Q8K0U3 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tmem17Q8K0U3 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tmem17Q8K0U3 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tmem17Q8K0U3 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tmem17Q8K0U3 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Tmem17Q8K0U3 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tmem17Q8K0U3 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tmem17Q8K0U3 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Tmem17Q8K0U3 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tmem17Q8K0U3 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tmem17Q8K0U3 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tmem17Q8K0U3 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tmem17Q8K0U3 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tmem17Q8K0U3 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Tmem17Q8K0U3 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tmem17Q8K0U3 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tmem17Q8K0U3 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tmem17Q8K0U3 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tmem17Q8K0U3 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tmem17Q8K0U3 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tmem17Q8K0U3 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tmem17Q8K0U3 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tmem17Q8K0U3 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tmem17Q8K0U3 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Tmem17Q8K0U3 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tmem17Q8K0U3 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tmem17Q8K0U3 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tmem17Q8K0U3 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tmem17Q8K0U3 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Tmem17Q8K0U3 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tmem17Q8K0U3 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tmem17Q8K0U3 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tmem17Q8K0U3 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tmem17Q8K0U3 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tmem17Q8K0U3 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tmem17Q8K0U3 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tmem17Q8K0U3 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tmem17Q8K0U3 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tmem17Q8K0U3 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tmem17Q8K0U3 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tmem17Q8K0U3 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tmem17Q8K0U3 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tmem17Q8K0U3 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tmem17Q8K0U3 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tmem17Q8K0U3 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tmem17Q8K0U3 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tmem17Q8K0U3 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tmem17Q8K0U3 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Tmem17Q8K0U3 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tmem17Q8K0U3 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tmem17Q8K0U3 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tmem17Q8K0U3 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tmem17Q8K0U3 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tmem17Q8K0U3 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tmem17Q8K0U3 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tmem17Q8K0U3 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tmem17Q8K0U3 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tmem17Q8K0U3 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tmem17Q8K0U3 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tmem17Q8K0U3 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tmem17Q8K0U3 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tmem17Q8K0U3 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tmem17Q8K0U3 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tmem17Q8K0U3 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tmem17Q8K0U3 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tmem17Q8K0U3 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tmem17Q8K0U3 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tmem17Q8K0U3 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tmem17Q8K0U3 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Tmem17Q8K0U3 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Tmem17Q8K0U3 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Tmem17Q8K0U3 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Tmem17Q8K0U3 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tmem17Q8K0U3 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tmem17Q8K0U3 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tmem17Q8K0U3 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tmem17Q8K0U3 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tmem17Q8K0U3 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tmem17Q8K0U3 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tmem17Q8K0U3 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tmem17Q8K0U3 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmem17Q8K0U3 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmem17Q8K0U3 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmem17Q8K0U3 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmem17Q8K0U3 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms