Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZQ2

Afg3l2, AFG3-like protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 802 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Afg3l2Q8JZQ2 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Afg3l2Q8JZQ2 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Afg3l2Q8JZQ2 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Afg3l2Q8JZQ2 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Afg3l2Q8JZQ2 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Afg3l2Q8JZQ2 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Afg3l2Q8JZQ2 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Afg3l2Q8JZQ2 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Afg3l2Q8JZQ2 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Afg3l2Q8JZQ2 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Afg3l2Q8JZQ2 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Afg3l2Q8JZQ2 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Afg3l2Q8JZQ2 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Afg3l2Q8JZQ2 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Afg3l2Q8JZQ2 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Afg3l2Q8JZQ2 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Afg3l2Q8JZQ2 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Afg3l2Q8JZQ2 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Afg3l2Q8JZQ2 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Afg3l2Q8JZQ2 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Afg3l2Q8JZQ2 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Afg3l2Q8JZQ2 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Afg3l2Q8JZQ2 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Afg3l2Q8JZQ2 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Afg3l2Q8JZQ2 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Afg3l2Q8JZQ2 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Afg3l2Q8JZQ2 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Afg3l2Q8JZQ2 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Afg3l2Q8JZQ2 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Afg3l2Q8JZQ2 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Afg3l2Q8JZQ2 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Afg3l2Q8JZQ2 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Afg3l2Q8JZQ2 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Afg3l2Q8JZQ2 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Afg3l2Q8JZQ2 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Afg3l2Q8JZQ2 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Afg3l2Q8JZQ2 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Afg3l2Q8JZQ2 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Afg3l2Q8JZQ2 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Afg3l2Q8JZQ2 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Afg3l2Q8JZQ2 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Afg3l2Q8JZQ2 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Afg3l2Q8JZQ2 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Afg3l2Q8JZQ2 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Afg3l2Q8JZQ2 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Afg3l2Q8JZQ2 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Afg3l2Q8JZQ2 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Afg3l2Q8JZQ2 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Afg3l2Q8JZQ2 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Afg3l2Q8JZQ2 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Afg3l2Q8JZQ2 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Afg3l2Q8JZQ2 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Afg3l2Q8JZQ2 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Afg3l2Q8JZQ2 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Afg3l2Q8JZQ2 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Afg3l2Q8JZQ2 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Afg3l2Q8JZQ2 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Afg3l2Q8JZQ2 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Afg3l2Q8JZQ2 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Afg3l2Q8JZQ2 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Afg3l2Q8JZQ2 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Afg3l2Q8JZQ2 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Afg3l2Q8JZQ2 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Afg3l2Q8JZQ2 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Afg3l2Q8JZQ2 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Afg3l2Q8JZQ2 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Afg3l2Q8JZQ2 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Afg3l2Q8JZQ2 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Afg3l2Q8JZQ2 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Afg3l2Q8JZQ2 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Afg3l2Q8JZQ2 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Afg3l2Q8JZQ2 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Afg3l2Q8JZQ2 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Afg3l2Q8JZQ2 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Afg3l2Q8JZQ2 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Afg3l2Q8JZQ2 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Afg3l2Q8JZQ2 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Afg3l2Q8JZQ2 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Afg3l2Q8JZQ2 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Afg3l2Q8JZQ2 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Afg3l2Q8JZQ2 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Afg3l2Q8JZQ2 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Afg3l2Q8JZQ2 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Afg3l2Q8JZQ2 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Afg3l2Q8JZQ2 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Afg3l2Q8JZQ2 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Afg3l2Q8JZQ2 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Afg3l2Q8JZQ2 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Afg3l2Q8JZQ2 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Afg3l2Q8JZQ2 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Afg3l2Q8JZQ2 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Afg3l2Q8JZQ2 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Afg3l2Q8JZQ2 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Afg3l2Q8JZQ2 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Afg3l2Q8JZQ2 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Afg3l2Q8JZQ2 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Afg3l2Q8JZQ2 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Afg3l2Q8JZQ2 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Afg3l2Q8JZQ2 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Afg3l2Q8JZQ2 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms