Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYM2

SLFN12, Schlafen family member 12, humanhuman

Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN12Q8IYM2 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLFN12Q8IYM2 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLFN12Q8IYM2 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLFN12Q8IYM2 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLFN12Q8IYM2 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLFN12Q8IYM2 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLFN12Q8IYM2 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLFN12Q8IYM2 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLFN12Q8IYM2 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLFN12Q8IYM2 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SLFN12Q8IYM2 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLFN12Q8IYM2 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLFN12Q8IYM2 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLFN12Q8IYM2 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLFN12Q8IYM2 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLFN12Q8IYM2 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLFN12Q8IYM2 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLFN12Q8IYM2 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLFN12Q8IYM2 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLFN12Q8IYM2 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLFN12Q8IYM2 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLFN12Q8IYM2 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLFN12Q8IYM2 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLFN12Q8IYM2 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLFN12Q8IYM2 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLFN12Q8IYM2 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLFN12Q8IYM2 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLFN12Q8IYM2 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLFN12Q8IYM2 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SLFN12Q8IYM2 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLFN12Q8IYM2 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLFN12Q8IYM2 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLFN12Q8IYM2 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLFN12Q8IYM2 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLFN12Q8IYM2 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLFN12Q8IYM2 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLFN12Q8IYM2 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLFN12Q8IYM2 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SLFN12Q8IYM2 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLFN12Q8IYM2 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SLFN12Q8IYM2 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLFN12Q8IYM2 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLFN12Q8IYM2 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLFN12Q8IYM2 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SLFN12Q8IYM2 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLFN12Q8IYM2 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLFN12Q8IYM2 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLFN12Q8IYM2 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SLFN12Q8IYM2 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLFN12Q8IYM2 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLFN12Q8IYM2 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLFN12Q8IYM2 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLFN12Q8IYM2 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLFN12Q8IYM2 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLFN12Q8IYM2 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLFN12Q8IYM2 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLFN12Q8IYM2 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLFN12Q8IYM2 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLFN12Q8IYM2 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLFN12Q8IYM2 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLFN12Q8IYM2 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLFN12Q8IYM2 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SLFN12Q8IYM2 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLFN12Q8IYM2 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLFN12Q8IYM2 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLFN12Q8IYM2 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLFN12Q8IYM2 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SLFN12Q8IYM2 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SLFN12Q8IYM2 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLFN12Q8IYM2 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLFN12Q8IYM2 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLFN12Q8IYM2 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLFN12Q8IYM2 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLFN12Q8IYM2 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLFN12Q8IYM2 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLFN12Q8IYM2 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLFN12Q8IYM2 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLFN12Q8IYM2 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SLFN12Q8IYM2 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLFN12Q8IYM2 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SLFN12Q8IYM2 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLFN12Q8IYM2 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLFN12Q8IYM2 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SLFN12Q8IYM2 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SLFN12Q8IYM2 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLFN12Q8IYM2 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLFN12Q8IYM2 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLFN12Q8IYM2 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLFN12Q8IYM2 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLFN12Q8IYM2 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLFN12Q8IYM2 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLFN12Q8IYM2 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLFN12Q8IYM2 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLFN12Q8IYM2 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLFN12Q8IYM2 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLFN12Q8IYM2 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SLFN12Q8IYM2 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLFN12Q8IYM2 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLFN12Q8IYM2 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLFN12Q8IYM2 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms