Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEQ0

Cdkl1, Cyclin-dependent kinase-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl1Q8CEQ0 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Cdkl1Q8CEQ0 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cdkl1Q8CEQ0 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cdkl1Q8CEQ0 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cdkl1Q8CEQ0 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Cdkl1Q8CEQ0 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cdkl1Q8CEQ0 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms