Protein–RNA interactions for Protein: Q8BYM7

Rsph4a, Radial spoke head protein 4 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 716 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph4aQ8BYM7 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Rsph4aQ8BYM7 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Rsph4aQ8BYM7 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Rsph4aQ8BYM7 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Rsph4aQ8BYM7 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Rsph4aQ8BYM7 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Rsph4aQ8BYM7 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Rsph4aQ8BYM7 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Rsph4aQ8BYM7 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Rsph4aQ8BYM7 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Rsph4aQ8BYM7 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Rsph4aQ8BYM7 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Rsph4aQ8BYM7 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Rsph4aQ8BYM7 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Rsph4aQ8BYM7 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Rsph4aQ8BYM7 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Rsph4aQ8BYM7 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Rsph4aQ8BYM7 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Rsph4aQ8BYM7 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Rsph4aQ8BYM7 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Rsph4aQ8BYM7 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Rsph4aQ8BYM7 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Rsph4aQ8BYM7 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Rsph4aQ8BYM7 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Rsph4aQ8BYM7 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Rsph4aQ8BYM7 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Rsph4aQ8BYM7 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Rsph4aQ8BYM7 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Rsph4aQ8BYM7 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Rsph4aQ8BYM7 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Rsph4aQ8BYM7 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Rsph4aQ8BYM7 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Rsph4aQ8BYM7 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Rsph4aQ8BYM7 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Rsph4aQ8BYM7 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Rsph4aQ8BYM7 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Rsph4aQ8BYM7 Cox17-201ENSMUST00000050273 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Rsph4aQ8BYM7 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Rsph4aQ8BYM7 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Rsph4aQ8BYM7 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Rsph4aQ8BYM7 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Rsph4aQ8BYM7 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Rsph4aQ8BYM7 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Rsph4aQ8BYM7 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Rsph4aQ8BYM7 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Rsph4aQ8BYM7 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Rsph4aQ8BYM7 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Rsph4aQ8BYM7 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Rsph4aQ8BYM7 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Rsph4aQ8BYM7 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Rsph4aQ8BYM7 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Rsph4aQ8BYM7 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Rsph4aQ8BYM7 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Rsph4aQ8BYM7 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Rsph4aQ8BYM7 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Rsph4aQ8BYM7 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Rsph4aQ8BYM7 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Rsph4aQ8BYM7 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Rsph4aQ8BYM7 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Rsph4aQ8BYM7 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Rsph4aQ8BYM7 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Rsph4aQ8BYM7 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Rsph4aQ8BYM7 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Rsph4aQ8BYM7 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Rsph4aQ8BYM7 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Rsph4aQ8BYM7 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Rsph4aQ8BYM7 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Rsph4aQ8BYM7 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Rsph4aQ8BYM7 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Rsph4aQ8BYM7 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Rsph4aQ8BYM7 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Rsph4aQ8BYM7 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Rsph4aQ8BYM7 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Rsph4aQ8BYM7 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Rsph4aQ8BYM7 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Rsph4aQ8BYM7 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Rsph4aQ8BYM7 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Rsph4aQ8BYM7 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Rsph4aQ8BYM7 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Rsph4aQ8BYM7 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Rsph4aQ8BYM7 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Rsph4aQ8BYM7 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Rsph4aQ8BYM7 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Rsph4aQ8BYM7 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Rsph4aQ8BYM7 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Rsph4aQ8BYM7 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Rsph4aQ8BYM7 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Rsph4aQ8BYM7 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Rsph4aQ8BYM7 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Rsph4aQ8BYM7 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rsph4aQ8BYM7 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rsph4aQ8BYM7 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rsph4aQ8BYM7 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rsph4aQ8BYM7 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rsph4aQ8BYM7 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rsph4aQ8BYM7 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Rsph4aQ8BYM7 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rsph4aQ8BYM7 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rsph4aQ8BYM7 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rsph4aQ8BYM7 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.9 ms