Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG40

Katnb1, Katanin p80 WD40 repeat-containing subunit B1, mousemouse

Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Katnb1Q8BG40 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Katnb1Q8BG40 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Katnb1Q8BG40 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Katnb1Q8BG40 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Katnb1Q8BG40 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Katnb1Q8BG40 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Katnb1Q8BG40 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Katnb1Q8BG40 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Katnb1Q8BG40 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Katnb1Q8BG40 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Katnb1Q8BG40 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Katnb1Q8BG40 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Katnb1Q8BG40 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Katnb1Q8BG40 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Katnb1Q8BG40 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Katnb1Q8BG40 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Katnb1Q8BG40 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Katnb1Q8BG40 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Katnb1Q8BG40 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Katnb1Q8BG40 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Katnb1Q8BG40 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Katnb1Q8BG40 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Katnb1Q8BG40 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Katnb1Q8BG40 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Katnb1Q8BG40 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Katnb1Q8BG40 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Katnb1Q8BG40 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Katnb1Q8BG40 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Katnb1Q8BG40 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Katnb1Q8BG40 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Katnb1Q8BG40 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Katnb1Q8BG40 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Katnb1Q8BG40 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Katnb1Q8BG40 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Katnb1Q8BG40 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Katnb1Q8BG40 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Katnb1Q8BG40 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Katnb1Q8BG40 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Katnb1Q8BG40 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Katnb1Q8BG40 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Katnb1Q8BG40 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Katnb1Q8BG40 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Katnb1Q8BG40 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Katnb1Q8BG40 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Katnb1Q8BG40 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Katnb1Q8BG40 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Katnb1Q8BG40 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Katnb1Q8BG40 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Katnb1Q8BG40 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Katnb1Q8BG40 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Katnb1Q8BG40 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Katnb1Q8BG40 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Katnb1Q8BG40 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Katnb1Q8BG40 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Katnb1Q8BG40 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Katnb1Q8BG40 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Katnb1Q8BG40 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Katnb1Q8BG40 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Katnb1Q8BG40 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Katnb1Q8BG40 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Katnb1Q8BG40 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Katnb1Q8BG40 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Katnb1Q8BG40 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Katnb1Q8BG40 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Katnb1Q8BG40 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Katnb1Q8BG40 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Katnb1Q8BG40 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Katnb1Q8BG40 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Katnb1Q8BG40 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Katnb1Q8BG40 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Katnb1Q8BG40 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Katnb1Q8BG40 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Katnb1Q8BG40 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Katnb1Q8BG40 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Katnb1Q8BG40 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Katnb1Q8BG40 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Katnb1Q8BG40 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Katnb1Q8BG40 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Katnb1Q8BG40 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Katnb1Q8BG40 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Katnb1Q8BG40 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Katnb1Q8BG40 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Katnb1Q8BG40 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Katnb1Q8BG40 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Katnb1Q8BG40 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Katnb1Q8BG40 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Katnb1Q8BG40 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Katnb1Q8BG40 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Katnb1Q8BG40 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Katnb1Q8BG40 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Katnb1Q8BG40 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Katnb1Q8BG40 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Katnb1Q8BG40 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Katnb1Q8BG40 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Katnb1Q8BG40 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Katnb1Q8BG40 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Katnb1Q8BG40 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Katnb1Q8BG40 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Katnb1Q8BG40 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Katnb1Q8BG40 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms