Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG27

9930022D16Rik, RIKEN cDNA 9930022D16 gene, mousemouse

Predictions only

Length 128 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
9930022D16RikQ8BG27 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
9930022D16RikQ8BG27 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
9930022D16RikQ8BG27 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
9930022D16RikQ8BG27 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
9930022D16RikQ8BG27 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
9930022D16RikQ8BG27 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
9930022D16RikQ8BG27 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
9930022D16RikQ8BG27 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
9930022D16RikQ8BG27 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
9930022D16RikQ8BG27 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
9930022D16RikQ8BG27 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
9930022D16RikQ8BG27 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
9930022D16RikQ8BG27 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
9930022D16RikQ8BG27 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
9930022D16RikQ8BG27 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
9930022D16RikQ8BG27 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
9930022D16RikQ8BG27 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
9930022D16RikQ8BG27 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
9930022D16RikQ8BG27 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
9930022D16RikQ8BG27 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
9930022D16RikQ8BG27 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
9930022D16RikQ8BG27 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
9930022D16RikQ8BG27 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
9930022D16RikQ8BG27 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
9930022D16RikQ8BG27 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
9930022D16RikQ8BG27 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
9930022D16RikQ8BG27 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
9930022D16RikQ8BG27 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
9930022D16RikQ8BG27 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
9930022D16RikQ8BG27 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
9930022D16RikQ8BG27 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
9930022D16RikQ8BG27 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
9930022D16RikQ8BG27 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
9930022D16RikQ8BG27 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
9930022D16RikQ8BG27 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
9930022D16RikQ8BG27 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
9930022D16RikQ8BG27 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
9930022D16RikQ8BG27 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
9930022D16RikQ8BG27 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
9930022D16RikQ8BG27 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
9930022D16RikQ8BG27 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
9930022D16RikQ8BG27 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
9930022D16RikQ8BG27 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
9930022D16RikQ8BG27 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
9930022D16RikQ8BG27 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
9930022D16RikQ8BG27 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
9930022D16RikQ8BG27 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
9930022D16RikQ8BG27 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
9930022D16RikQ8BG27 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
9930022D16RikQ8BG27 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
9930022D16RikQ8BG27 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
9930022D16RikQ8BG27 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
9930022D16RikQ8BG27 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
9930022D16RikQ8BG27 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
9930022D16RikQ8BG27 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
9930022D16RikQ8BG27 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
9930022D16RikQ8BG27 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
9930022D16RikQ8BG27 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
9930022D16RikQ8BG27 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
9930022D16RikQ8BG27 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
9930022D16RikQ8BG27 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
9930022D16RikQ8BG27 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
9930022D16RikQ8BG27 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
9930022D16RikQ8BG27 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
9930022D16RikQ8BG27 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
9930022D16RikQ8BG27 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
9930022D16RikQ8BG27 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
9930022D16RikQ8BG27 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
9930022D16RikQ8BG27 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
9930022D16RikQ8BG27 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
9930022D16RikQ8BG27 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
9930022D16RikQ8BG27 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
9930022D16RikQ8BG27 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
9930022D16RikQ8BG27 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
9930022D16RikQ8BG27 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
9930022D16RikQ8BG27 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
9930022D16RikQ8BG27 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
9930022D16RikQ8BG27 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
9930022D16RikQ8BG27 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
9930022D16RikQ8BG27 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
9930022D16RikQ8BG27 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
9930022D16RikQ8BG27 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
9930022D16RikQ8BG27 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
9930022D16RikQ8BG27 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
9930022D16RikQ8BG27 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
9930022D16RikQ8BG27 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
9930022D16RikQ8BG27 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
9930022D16RikQ8BG27 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
9930022D16RikQ8BG27 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
9930022D16RikQ8BG27 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
9930022D16RikQ8BG27 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
9930022D16RikQ8BG27 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
9930022D16RikQ8BG27 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
9930022D16RikQ8BG27 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
9930022D16RikQ8BG27 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
9930022D16RikQ8BG27 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
9930022D16RikQ8BG27 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
9930022D16RikQ8BG27 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
9930022D16RikQ8BG27 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
9930022D16RikQ8BG27 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms