Protein–RNA interactions for Protein: Q80U12

Sgsm2, Small G protein signaling modulator 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,005 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgsm2Q80U12 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sgsm2Q80U12 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sgsm2Q80U12 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sgsm2Q80U12 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sgsm2Q80U12 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sgsm2Q80U12 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sgsm2Q80U12 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sgsm2Q80U12 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sgsm2Q80U12 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sgsm2Q80U12 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sgsm2Q80U12 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sgsm2Q80U12 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sgsm2Q80U12 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sgsm2Q80U12 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sgsm2Q80U12 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sgsm2Q80U12 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sgsm2Q80U12 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sgsm2Q80U12 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sgsm2Q80U12 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sgsm2Q80U12 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sgsm2Q80U12 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sgsm2Q80U12 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sgsm2Q80U12 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sgsm2Q80U12 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sgsm2Q80U12 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sgsm2Q80U12 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sgsm2Q80U12 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sgsm2Q80U12 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sgsm2Q80U12 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sgsm2Q80U12 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Sgsm2Q80U12 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Sgsm2Q80U12 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Sgsm2Q80U12 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sgsm2Q80U12 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sgsm2Q80U12 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sgsm2Q80U12 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Sgsm2Q80U12 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Sgsm2Q80U12 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sgsm2Q80U12 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sgsm2Q80U12 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sgsm2Q80U12 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sgsm2Q80U12 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sgsm2Q80U12 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sgsm2Q80U12 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sgsm2Q80U12 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sgsm2Q80U12 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sgsm2Q80U12 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sgsm2Q80U12 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sgsm2Q80U12 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sgsm2Q80U12 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sgsm2Q80U12 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sgsm2Q80U12 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sgsm2Q80U12 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sgsm2Q80U12 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sgsm2Q80U12 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sgsm2Q80U12 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sgsm2Q80U12 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sgsm2Q80U12 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sgsm2Q80U12 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sgsm2Q80U12 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sgsm2Q80U12 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sgsm2Q80U12 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sgsm2Q80U12 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sgsm2Q80U12 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sgsm2Q80U12 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sgsm2Q80U12 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sgsm2Q80U12 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sgsm2Q80U12 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Sgsm2Q80U12 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sgsm2Q80U12 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sgsm2Q80U12 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sgsm2Q80U12 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sgsm2Q80U12 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sgsm2Q80U12 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sgsm2Q80U12 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sgsm2Q80U12 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sgsm2Q80U12 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sgsm2Q80U12 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sgsm2Q80U12 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sgsm2Q80U12 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sgsm2Q80U12 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sgsm2Q80U12 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sgsm2Q80U12 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sgsm2Q80U12 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sgsm2Q80U12 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sgsm2Q80U12 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sgsm2Q80U12 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Sgsm2Q80U12 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Sgsm2Q80U12 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Sgsm2Q80U12 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sgsm2Q80U12 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sgsm2Q80U12 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sgsm2Q80U12 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sgsm2Q80U12 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sgsm2Q80U12 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sgsm2Q80U12 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sgsm2Q80U12 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sgsm2Q80U12 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sgsm2Q80U12 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sgsm2Q80U12 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms