Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZTW0

TPGS1, Tubulin polyglutamylase complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPGS1Q6ZTW0 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TPGS1Q6ZTW0 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TPGS1Q6ZTW0 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TPGS1Q6ZTW0 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TPGS1Q6ZTW0 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TPGS1Q6ZTW0 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TPGS1Q6ZTW0 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TPGS1Q6ZTW0 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TPGS1Q6ZTW0 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TPGS1Q6ZTW0 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TPGS1Q6ZTW0 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TPGS1Q6ZTW0 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TPGS1Q6ZTW0 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TPGS1Q6ZTW0 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TPGS1Q6ZTW0 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TPGS1Q6ZTW0 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TPGS1Q6ZTW0 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TPGS1Q6ZTW0 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TPGS1Q6ZTW0 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TPGS1Q6ZTW0 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TPGS1Q6ZTW0 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TPGS1Q6ZTW0 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TPGS1Q6ZTW0 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TPGS1Q6ZTW0 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TPGS1Q6ZTW0 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TPGS1Q6ZTW0 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TPGS1Q6ZTW0 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TPGS1Q6ZTW0 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TPGS1Q6ZTW0 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TPGS1Q6ZTW0 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TPGS1Q6ZTW0 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TPGS1Q6ZTW0 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TPGS1Q6ZTW0 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TPGS1Q6ZTW0 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TPGS1Q6ZTW0 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TPGS1Q6ZTW0 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TPGS1Q6ZTW0 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TPGS1Q6ZTW0 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TPGS1Q6ZTW0 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TPGS1Q6ZTW0 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TPGS1Q6ZTW0 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TPGS1Q6ZTW0 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TPGS1Q6ZTW0 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TPGS1Q6ZTW0 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TPGS1Q6ZTW0 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TPGS1Q6ZTW0 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TPGS1Q6ZTW0 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TPGS1Q6ZTW0 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TPGS1Q6ZTW0 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TPGS1Q6ZTW0 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TPGS1Q6ZTW0 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TPGS1Q6ZTW0 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TPGS1Q6ZTW0 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TPGS1Q6ZTW0 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TPGS1Q6ZTW0 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TPGS1Q6ZTW0 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TPGS1Q6ZTW0 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TPGS1Q6ZTW0 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TPGS1Q6ZTW0 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TPGS1Q6ZTW0 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TPGS1Q6ZTW0 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TPGS1Q6ZTW0 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TPGS1Q6ZTW0 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TPGS1Q6ZTW0 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TPGS1Q6ZTW0 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TPGS1Q6ZTW0 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TPGS1Q6ZTW0 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TPGS1Q6ZTW0 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TPGS1Q6ZTW0 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TPGS1Q6ZTW0 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TPGS1Q6ZTW0 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TPGS1Q6ZTW0 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TPGS1Q6ZTW0 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TPGS1Q6ZTW0 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TPGS1Q6ZTW0 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TPGS1Q6ZTW0 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TPGS1Q6ZTW0 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TPGS1Q6ZTW0 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TPGS1Q6ZTW0 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TPGS1Q6ZTW0 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TPGS1Q6ZTW0 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TPGS1Q6ZTW0 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TPGS1Q6ZTW0 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TPGS1Q6ZTW0 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TPGS1Q6ZTW0 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TPGS1Q6ZTW0 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TPGS1Q6ZTW0 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TPGS1Q6ZTW0 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TPGS1Q6ZTW0 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TPGS1Q6ZTW0 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TPGS1Q6ZTW0 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TPGS1Q6ZTW0 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TPGS1Q6ZTW0 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TPGS1Q6ZTW0 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TPGS1Q6ZTW0 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TPGS1Q6ZTW0 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TPGS1Q6ZTW0 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TPGS1Q6ZTW0 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TPGS1Q6ZTW0 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TPGS1Q6ZTW0 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms