Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHS6

Snx13, Sorting nexin-13, mousemouse

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Length 957 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx13Q6PHS6 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Snx13Q6PHS6 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Snx13Q6PHS6 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Snx13Q6PHS6 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Snx13Q6PHS6 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Snx13Q6PHS6 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Snx13Q6PHS6 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Snx13Q6PHS6 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Snx13Q6PHS6 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Snx13Q6PHS6 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Snx13Q6PHS6 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Snx13Q6PHS6 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Snx13Q6PHS6 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Snx13Q6PHS6 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Snx13Q6PHS6 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Snx13Q6PHS6 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Snx13Q6PHS6 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Snx13Q6PHS6 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Snx13Q6PHS6 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Snx13Q6PHS6 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Snx13Q6PHS6 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Snx13Q6PHS6 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Snx13Q6PHS6 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Snx13Q6PHS6 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Snx13Q6PHS6 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Snx13Q6PHS6 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Snx13Q6PHS6 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Snx13Q6PHS6 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Snx13Q6PHS6 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Snx13Q6PHS6 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Snx13Q6PHS6 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Snx13Q6PHS6 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Snx13Q6PHS6 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Snx13Q6PHS6 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Snx13Q6PHS6 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Snx13Q6PHS6 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Snx13Q6PHS6 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Snx13Q6PHS6 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Snx13Q6PHS6 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Snx13Q6PHS6 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Snx13Q6PHS6 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Snx13Q6PHS6 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Snx13Q6PHS6 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Snx13Q6PHS6 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Snx13Q6PHS6 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Snx13Q6PHS6 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Snx13Q6PHS6 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Snx13Q6PHS6 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Snx13Q6PHS6 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Snx13Q6PHS6 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Snx13Q6PHS6 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Snx13Q6PHS6 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Snx13Q6PHS6 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Snx13Q6PHS6 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Snx13Q6PHS6 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Snx13Q6PHS6 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Snx13Q6PHS6 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Snx13Q6PHS6 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Snx13Q6PHS6 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Snx13Q6PHS6 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Snx13Q6PHS6 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Snx13Q6PHS6 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Snx13Q6PHS6 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Snx13Q6PHS6 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Snx13Q6PHS6 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Snx13Q6PHS6 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Snx13Q6PHS6 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Snx13Q6PHS6 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Snx13Q6PHS6 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Snx13Q6PHS6 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Snx13Q6PHS6 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Snx13Q6PHS6 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Snx13Q6PHS6 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Snx13Q6PHS6 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Snx13Q6PHS6 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Snx13Q6PHS6 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Snx13Q6PHS6 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Snx13Q6PHS6 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Snx13Q6PHS6 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Snx13Q6PHS6 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Snx13Q6PHS6 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Snx13Q6PHS6 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Snx13Q6PHS6 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Snx13Q6PHS6 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Snx13Q6PHS6 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Snx13Q6PHS6 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Snx13Q6PHS6 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Snx13Q6PHS6 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Snx13Q6PHS6 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Snx13Q6PHS6 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Snx13Q6PHS6 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Snx13Q6PHS6 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Snx13Q6PHS6 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21.7■■□□□ 1.07
Snx13Q6PHS6 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Snx13Q6PHS6 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Snx13Q6PHS6 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Snx13Q6PHS6 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Snx13Q6PHS6 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Snx13Q6PHS6 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Snx13Q6PHS6 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms