Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZQ4

Paxip1, PAX-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,056 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Paxip1Q6NZQ4 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Paxip1Q6NZQ4 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Paxip1Q6NZQ4 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Paxip1Q6NZQ4 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Paxip1Q6NZQ4 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Paxip1Q6NZQ4 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Paxip1Q6NZQ4 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Paxip1Q6NZQ4 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Paxip1Q6NZQ4 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Paxip1Q6NZQ4 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Paxip1Q6NZQ4 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Paxip1Q6NZQ4 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Paxip1Q6NZQ4 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Paxip1Q6NZQ4 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Paxip1Q6NZQ4 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Paxip1Q6NZQ4 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Paxip1Q6NZQ4 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Paxip1Q6NZQ4 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Paxip1Q6NZQ4 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Paxip1Q6NZQ4 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Paxip1Q6NZQ4 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Paxip1Q6NZQ4 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Paxip1Q6NZQ4 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Paxip1Q6NZQ4 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Paxip1Q6NZQ4 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Paxip1Q6NZQ4 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Paxip1Q6NZQ4 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Paxip1Q6NZQ4 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Paxip1Q6NZQ4 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Paxip1Q6NZQ4 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Paxip1Q6NZQ4 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Paxip1Q6NZQ4 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Paxip1Q6NZQ4 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Paxip1Q6NZQ4 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Paxip1Q6NZQ4 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Paxip1Q6NZQ4 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Paxip1Q6NZQ4 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Paxip1Q6NZQ4 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Paxip1Q6NZQ4 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Paxip1Q6NZQ4 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Paxip1Q6NZQ4 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Paxip1Q6NZQ4 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Paxip1Q6NZQ4 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Paxip1Q6NZQ4 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Paxip1Q6NZQ4 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Paxip1Q6NZQ4 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Paxip1Q6NZQ4 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Paxip1Q6NZQ4 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Paxip1Q6NZQ4 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Paxip1Q6NZQ4 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Paxip1Q6NZQ4 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Paxip1Q6NZQ4 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Paxip1Q6NZQ4 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Paxip1Q6NZQ4 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Paxip1Q6NZQ4 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Paxip1Q6NZQ4 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Paxip1Q6NZQ4 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Paxip1Q6NZQ4 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Paxip1Q6NZQ4 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Paxip1Q6NZQ4 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Paxip1Q6NZQ4 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Paxip1Q6NZQ4 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Paxip1Q6NZQ4 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Paxip1Q6NZQ4 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Paxip1Q6NZQ4 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Paxip1Q6NZQ4 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Paxip1Q6NZQ4 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Paxip1Q6NZQ4 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Paxip1Q6NZQ4 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Paxip1Q6NZQ4 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Paxip1Q6NZQ4 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Paxip1Q6NZQ4 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Paxip1Q6NZQ4 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Paxip1Q6NZQ4 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Paxip1Q6NZQ4 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Paxip1Q6NZQ4 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Paxip1Q6NZQ4 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Paxip1Q6NZQ4 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Paxip1Q6NZQ4 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Paxip1Q6NZQ4 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Paxip1Q6NZQ4 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Paxip1Q6NZQ4 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Paxip1Q6NZQ4 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Paxip1Q6NZQ4 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Paxip1Q6NZQ4 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Paxip1Q6NZQ4 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Paxip1Q6NZQ4 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Paxip1Q6NZQ4 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Paxip1Q6NZQ4 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Paxip1Q6NZQ4 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Paxip1Q6NZQ4 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Paxip1Q6NZQ4 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Paxip1Q6NZQ4 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Paxip1Q6NZQ4 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Paxip1Q6NZQ4 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Paxip1Q6NZQ4 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Paxip1Q6NZQ4 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Paxip1Q6NZQ4 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Paxip1Q6NZQ4 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Paxip1Q6NZQ4 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms