Protein–RNA interactions for Protein: Q60772

Cdkn2c, Cyclin-dependent kinase 4 inhibitor C, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn2cQ60772 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cdkn2cQ60772 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cdkn2cQ60772 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cdkn2cQ60772 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cdkn2cQ60772 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cdkn2cQ60772 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cdkn2cQ60772 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cdkn2cQ60772 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cdkn2cQ60772 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cdkn2cQ60772 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cdkn2cQ60772 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cdkn2cQ60772 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cdkn2cQ60772 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cdkn2cQ60772 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cdkn2cQ60772 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cdkn2cQ60772 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cdkn2cQ60772 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cdkn2cQ60772 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cdkn2cQ60772 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cdkn2cQ60772 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cdkn2cQ60772 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cdkn2cQ60772 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cdkn2cQ60772 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cdkn2cQ60772 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cdkn2cQ60772 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cdkn2cQ60772 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cdkn2cQ60772 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cdkn2cQ60772 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cdkn2cQ60772 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Cdkn2cQ60772 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cdkn2cQ60772 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cdkn2cQ60772 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cdkn2cQ60772 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cdkn2cQ60772 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cdkn2cQ60772 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cdkn2cQ60772 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Cdkn2cQ60772 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cdkn2cQ60772 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cdkn2cQ60772 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cdkn2cQ60772 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cdkn2cQ60772 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cdkn2cQ60772 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cdkn2cQ60772 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Cdkn2cQ60772 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cdkn2cQ60772 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cdkn2cQ60772 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cdkn2cQ60772 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cdkn2cQ60772 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Cdkn2cQ60772 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cdkn2cQ60772 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cdkn2cQ60772 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cdkn2cQ60772 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cdkn2cQ60772 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cdkn2cQ60772 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cdkn2cQ60772 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cdkn2cQ60772 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Cdkn2cQ60772 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cdkn2cQ60772 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cdkn2cQ60772 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cdkn2cQ60772 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cdkn2cQ60772 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cdkn2cQ60772 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cdkn2cQ60772 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cdkn2cQ60772 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cdkn2cQ60772 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cdkn2cQ60772 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cdkn2cQ60772 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cdkn2cQ60772 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cdkn2cQ60772 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cdkn2cQ60772 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cdkn2cQ60772 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Cdkn2cQ60772 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cdkn2cQ60772 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cdkn2cQ60772 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cdkn2cQ60772 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cdkn2cQ60772 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cdkn2cQ60772 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cdkn2cQ60772 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cdkn2cQ60772 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cdkn2cQ60772 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cdkn2cQ60772 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cdkn2cQ60772 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cdkn2cQ60772 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cdkn2cQ60772 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cdkn2cQ60772 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cdkn2cQ60772 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cdkn2cQ60772 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cdkn2cQ60772 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cdkn2cQ60772 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cdkn2cQ60772 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cdkn2cQ60772 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cdkn2cQ60772 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cdkn2cQ60772 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cdkn2cQ60772 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cdkn2cQ60772 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cdkn2cQ60772 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cdkn2cQ60772 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cdkn2cQ60772 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cdkn2cQ60772 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cdkn2cQ60772 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms