Protein–RNA interactions for Protein: Q60670

Sik1, Serine/threonine-protein kinase SIK1, mousemouse

Predictions only

Length 779 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sik1Q60670 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sik1Q60670 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sik1Q60670 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sik1Q60670 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sik1Q60670 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sik1Q60670 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sik1Q60670 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sik1Q60670 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sik1Q60670 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sik1Q60670 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Sik1Q60670 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sik1Q60670 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sik1Q60670 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sik1Q60670 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sik1Q60670 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sik1Q60670 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sik1Q60670 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sik1Q60670 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sik1Q60670 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sik1Q60670 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sik1Q60670 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sik1Q60670 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Sik1Q60670 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Sik1Q60670 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Sik1Q60670 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Sik1Q60670 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Sik1Q60670 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Sik1Q60670 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Sik1Q60670 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Sik1Q60670 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Sik1Q60670 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Sik1Q60670 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Sik1Q60670 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Sik1Q60670 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Sik1Q60670 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Sik1Q60670 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Sik1Q60670 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sik1Q60670 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sik1Q60670 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sik1Q60670 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sik1Q60670 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sik1Q60670 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sik1Q60670 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sik1Q60670 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sik1Q60670 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sik1Q60670 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sik1Q60670 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sik1Q60670 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sik1Q60670 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sik1Q60670 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sik1Q60670 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sik1Q60670 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Sik1Q60670 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sik1Q60670 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sik1Q60670 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sik1Q60670 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sik1Q60670 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sik1Q60670 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sik1Q60670 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sik1Q60670 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sik1Q60670 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sik1Q60670 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sik1Q60670 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sik1Q60670 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sik1Q60670 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sik1Q60670 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sik1Q60670 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sik1Q60670 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sik1Q60670 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sik1Q60670 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Sik1Q60670 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Sik1Q60670 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Sik1Q60670 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Sik1Q60670 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Sik1Q60670 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Sik1Q60670 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Sik1Q60670 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Sik1Q60670 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Sik1Q60670 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sik1Q60670 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sik1Q60670 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Sik1Q60670 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sik1Q60670 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sik1Q60670 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sik1Q60670 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sik1Q60670 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sik1Q60670 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sik1Q60670 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sik1Q60670 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sik1Q60670 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sik1Q60670 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sik1Q60670 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sik1Q60670 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sik1Q60670 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sik1Q60670 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Sik1Q60670 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sik1Q60670 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sik1Q60670 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sik1Q60670 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sik1Q60670 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms