Protein–RNA interactions for Protein: Q5XG71

Utp20, Small subunit processome component 20 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp20Q5XG71 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Utp20Q5XG71 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Utp20Q5XG71 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Utp20Q5XG71 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Utp20Q5XG71 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Utp20Q5XG71 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Utp20Q5XG71 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Utp20Q5XG71 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Utp20Q5XG71 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Utp20Q5XG71 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Utp20Q5XG71 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Utp20Q5XG71 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Utp20Q5XG71 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Utp20Q5XG71 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Utp20Q5XG71 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Utp20Q5XG71 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Utp20Q5XG71 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Utp20Q5XG71 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Utp20Q5XG71 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Utp20Q5XG71 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Utp20Q5XG71 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Utp20Q5XG71 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Utp20Q5XG71 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Utp20Q5XG71 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Utp20Q5XG71 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Utp20Q5XG71 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Utp20Q5XG71 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Utp20Q5XG71 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Utp20Q5XG71 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Utp20Q5XG71 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Utp20Q5XG71 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Utp20Q5XG71 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Utp20Q5XG71 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Utp20Q5XG71 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Utp20Q5XG71 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Utp20Q5XG71 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Utp20Q5XG71 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Utp20Q5XG71 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Utp20Q5XG71 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Utp20Q5XG71 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Utp20Q5XG71 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Utp20Q5XG71 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Utp20Q5XG71 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Utp20Q5XG71 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Utp20Q5XG71 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Utp20Q5XG71 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Utp20Q5XG71 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Utp20Q5XG71 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Utp20Q5XG71 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Utp20Q5XG71 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Utp20Q5XG71 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Utp20Q5XG71 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Utp20Q5XG71 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Utp20Q5XG71 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Utp20Q5XG71 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Utp20Q5XG71 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Utp20Q5XG71 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Utp20Q5XG71 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Utp20Q5XG71 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Utp20Q5XG71 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Utp20Q5XG71 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Utp20Q5XG71 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Utp20Q5XG71 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Utp20Q5XG71 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Utp20Q5XG71 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Utp20Q5XG71 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Utp20Q5XG71 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Utp20Q5XG71 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Utp20Q5XG71 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Utp20Q5XG71 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Utp20Q5XG71 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Utp20Q5XG71 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Utp20Q5XG71 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Utp20Q5XG71 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Utp20Q5XG71 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Utp20Q5XG71 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Utp20Q5XG71 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Utp20Q5XG71 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Utp20Q5XG71 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Utp20Q5XG71 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Utp20Q5XG71 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Utp20Q5XG71 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Utp20Q5XG71 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Utp20Q5XG71 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Utp20Q5XG71 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Utp20Q5XG71 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Utp20Q5XG71 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Utp20Q5XG71 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Utp20Q5XG71 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Utp20Q5XG71 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Utp20Q5XG71 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Utp20Q5XG71 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Utp20Q5XG71 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Utp20Q5XG71 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Utp20Q5XG71 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Utp20Q5XG71 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Utp20Q5XG71 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Utp20Q5XG71 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Utp20Q5XG71 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Utp20Q5XG71 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms