Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sft2d1Q5SSN7 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sft2d1Q5SSN7 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sft2d1Q5SSN7 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sft2d1Q5SSN7 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sft2d1Q5SSN7 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sft2d1Q5SSN7 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sft2d1Q5SSN7 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sft2d1Q5SSN7 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sft2d1Q5SSN7 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sft2d1Q5SSN7 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sft2d1Q5SSN7 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sft2d1Q5SSN7 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sft2d1Q5SSN7 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sft2d1Q5SSN7 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sft2d1Q5SSN7 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sft2d1Q5SSN7 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sft2d1Q5SSN7 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sft2d1Q5SSN7 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sft2d1Q5SSN7 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sft2d1Q5SSN7 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sft2d1Q5SSN7 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sft2d1Q5SSN7 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sft2d1Q5SSN7 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sft2d1Q5SSN7 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sft2d1Q5SSN7 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sft2d1Q5SSN7 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sft2d1Q5SSN7 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sft2d1Q5SSN7 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sft2d1Q5SSN7 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sft2d1Q5SSN7 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sft2d1Q5SSN7 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sft2d1Q5SSN7 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sft2d1Q5SSN7 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sft2d1Q5SSN7 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sft2d1Q5SSN7 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sft2d1Q5SSN7 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sft2d1Q5SSN7 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sft2d1Q5SSN7 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sft2d1Q5SSN7 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sft2d1Q5SSN7 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Sft2d1Q5SSN7 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Sft2d1Q5SSN7 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sft2d1Q5SSN7 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Sft2d1Q5SSN7 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sft2d1Q5SSN7 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sft2d1Q5SSN7 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sft2d1Q5SSN7 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sft2d1Q5SSN7 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sft2d1Q5SSN7 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sft2d1Q5SSN7 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sft2d1Q5SSN7 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sft2d1Q5SSN7 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sft2d1Q5SSN7 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sft2d1Q5SSN7 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sft2d1Q5SSN7 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sft2d1Q5SSN7 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sft2d1Q5SSN7 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sft2d1Q5SSN7 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sft2d1Q5SSN7 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sft2d1Q5SSN7 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sft2d1Q5SSN7 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sft2d1Q5SSN7 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sft2d1Q5SSN7 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sft2d1Q5SSN7 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sft2d1Q5SSN7 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sft2d1Q5SSN7 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sft2d1Q5SSN7 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sft2d1Q5SSN7 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sft2d1Q5SSN7 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sft2d1Q5SSN7 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sft2d1Q5SSN7 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sft2d1Q5SSN7 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sft2d1Q5SSN7 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sft2d1Q5SSN7 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sft2d1Q5SSN7 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sft2d1Q5SSN7 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sft2d1Q5SSN7 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Sft2d1Q5SSN7 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sft2d1Q5SSN7 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Sft2d1Q5SSN7 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sft2d1Q5SSN7 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sft2d1Q5SSN7 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sft2d1Q5SSN7 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sft2d1Q5SSN7 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sft2d1Q5SSN7 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sft2d1Q5SSN7 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sft2d1Q5SSN7 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sft2d1Q5SSN7 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Sft2d1Q5SSN7 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sft2d1Q5SSN7 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sft2d1Q5SSN7 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sft2d1Q5SSN7 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sft2d1Q5SSN7 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sft2d1Q5SSN7 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sft2d1Q5SSN7 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sft2d1Q5SSN7 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sft2d1Q5SSN7 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Sft2d1Q5SSN7 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sft2d1Q5SSN7 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms