Protein–RNA interactions for Protein: Q502W6

VWA3B, von Willebrand factor A domain-containing protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 1,294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA3BQ502W6 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
VWA3BQ502W6 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
VWA3BQ502W6 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
VWA3BQ502W6 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
VWA3BQ502W6 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
VWA3BQ502W6 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
VWA3BQ502W6 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
VWA3BQ502W6 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
VWA3BQ502W6 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
VWA3BQ502W6 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
VWA3BQ502W6 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
VWA3BQ502W6 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
VWA3BQ502W6 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
VWA3BQ502W6 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
VWA3BQ502W6 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
VWA3BQ502W6 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
VWA3BQ502W6 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
VWA3BQ502W6 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
VWA3BQ502W6 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
VWA3BQ502W6 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
VWA3BQ502W6 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
VWA3BQ502W6 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
VWA3BQ502W6 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
VWA3BQ502W6 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
VWA3BQ502W6 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
VWA3BQ502W6 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
VWA3BQ502W6 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
VWA3BQ502W6 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
VWA3BQ502W6 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
VWA3BQ502W6 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
VWA3BQ502W6 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
VWA3BQ502W6 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
VWA3BQ502W6 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
VWA3BQ502W6 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
VWA3BQ502W6 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
VWA3BQ502W6 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
VWA3BQ502W6 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
VWA3BQ502W6 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
VWA3BQ502W6 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
VWA3BQ502W6 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
VWA3BQ502W6 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
VWA3BQ502W6 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
VWA3BQ502W6 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
VWA3BQ502W6 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
VWA3BQ502W6 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
VWA3BQ502W6 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
VWA3BQ502W6 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
VWA3BQ502W6 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
VWA3BQ502W6 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
VWA3BQ502W6 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
VWA3BQ502W6 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
VWA3BQ502W6 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
VWA3BQ502W6 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
VWA3BQ502W6 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
VWA3BQ502W6 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
VWA3BQ502W6 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
VWA3BQ502W6 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
VWA3BQ502W6 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
VWA3BQ502W6 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
VWA3BQ502W6 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
VWA3BQ502W6 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
VWA3BQ502W6 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
VWA3BQ502W6 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
VWA3BQ502W6 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
VWA3BQ502W6 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
VWA3BQ502W6 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
VWA3BQ502W6 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
VWA3BQ502W6 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
VWA3BQ502W6 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
VWA3BQ502W6 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
VWA3BQ502W6 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
VWA3BQ502W6 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
VWA3BQ502W6 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
VWA3BQ502W6 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
VWA3BQ502W6 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
VWA3BQ502W6 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
VWA3BQ502W6 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
VWA3BQ502W6 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
VWA3BQ502W6 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
VWA3BQ502W6 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
VWA3BQ502W6 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
VWA3BQ502W6 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
VWA3BQ502W6 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
VWA3BQ502W6 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
VWA3BQ502W6 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
VWA3BQ502W6 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
VWA3BQ502W6 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
VWA3BQ502W6 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
VWA3BQ502W6 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
VWA3BQ502W6 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
VWA3BQ502W6 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
VWA3BQ502W6 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
VWA3BQ502W6 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
VWA3BQ502W6 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
VWA3BQ502W6 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
VWA3BQ502W6 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
VWA3BQ502W6 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
VWA3BQ502W6 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
VWA3BQ502W6 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
VWA3BQ502W6 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms