Protein–RNA interactions for Protein: Q45VN2

Defa20, Alpha-defensin 20, mousemouse

Predictions only

Length 95 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa20Q45VN2 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Defa20Q45VN2 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Defa20Q45VN2 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Defa20Q45VN2 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Defa20Q45VN2 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Defa20Q45VN2 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Defa20Q45VN2 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Defa20Q45VN2 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Defa20Q45VN2 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Defa20Q45VN2 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Defa20Q45VN2 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Defa20Q45VN2 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Defa20Q45VN2 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Defa20Q45VN2 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Defa20Q45VN2 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Defa20Q45VN2 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Defa20Q45VN2 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Defa20Q45VN2 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Defa20Q45VN2 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Defa20Q45VN2 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Defa20Q45VN2 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Defa20Q45VN2 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Defa20Q45VN2 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Defa20Q45VN2 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Defa20Q45VN2 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Defa20Q45VN2 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Defa20Q45VN2 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Defa20Q45VN2 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Defa20Q45VN2 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Defa20Q45VN2 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Defa20Q45VN2 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Defa20Q45VN2 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Defa20Q45VN2 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Defa20Q45VN2 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Defa20Q45VN2 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Defa20Q45VN2 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Defa20Q45VN2 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Defa20Q45VN2 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Defa20Q45VN2 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Defa20Q45VN2 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Defa20Q45VN2 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Defa20Q45VN2 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Defa20Q45VN2 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Defa20Q45VN2 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Defa20Q45VN2 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Defa20Q45VN2 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Defa20Q45VN2 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Defa20Q45VN2 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Defa20Q45VN2 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Defa20Q45VN2 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Defa20Q45VN2 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Defa20Q45VN2 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Defa20Q45VN2 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Defa20Q45VN2 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Defa20Q45VN2 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Defa20Q45VN2 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Defa20Q45VN2 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Defa20Q45VN2 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Defa20Q45VN2 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Defa20Q45VN2 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Defa20Q45VN2 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Defa20Q45VN2 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Defa20Q45VN2 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Defa20Q45VN2 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Defa20Q45VN2 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Defa20Q45VN2 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Defa20Q45VN2 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Defa20Q45VN2 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Defa20Q45VN2 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Defa20Q45VN2 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Defa20Q45VN2 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Defa20Q45VN2 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Defa20Q45VN2 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Defa20Q45VN2 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Defa20Q45VN2 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Defa20Q45VN2 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Defa20Q45VN2 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Defa20Q45VN2 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Defa20Q45VN2 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Defa20Q45VN2 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Defa20Q45VN2 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Defa20Q45VN2 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Defa20Q45VN2 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Defa20Q45VN2 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Defa20Q45VN2 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Defa20Q45VN2 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Defa20Q45VN2 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Defa20Q45VN2 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Defa20Q45VN2 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Defa20Q45VN2 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Defa20Q45VN2 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Defa20Q45VN2 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Defa20Q45VN2 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Defa20Q45VN2 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Defa20Q45VN2 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Defa20Q45VN2 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Defa20Q45VN2 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Defa20Q45VN2 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Defa20Q45VN2 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Defa20Q45VN2 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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