Protein–RNA interactions for Protein: Q3TX08

Trmt1, tRNA (guanine(26)-N(2))-dimethyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trmt1Q3TX08 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trmt1Q3TX08 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trmt1Q3TX08 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trmt1Q3TX08 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trmt1Q3TX08 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trmt1Q3TX08 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trmt1Q3TX08 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trmt1Q3TX08 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trmt1Q3TX08 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trmt1Q3TX08 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trmt1Q3TX08 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trmt1Q3TX08 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trmt1Q3TX08 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trmt1Q3TX08 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Trmt1Q3TX08 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trmt1Q3TX08 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trmt1Q3TX08 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Trmt1Q3TX08 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Trmt1Q3TX08 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trmt1Q3TX08 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trmt1Q3TX08 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trmt1Q3TX08 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trmt1Q3TX08 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trmt1Q3TX08 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trmt1Q3TX08 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trmt1Q3TX08 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trmt1Q3TX08 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Trmt1Q3TX08 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trmt1Q3TX08 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trmt1Q3TX08 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trmt1Q3TX08 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trmt1Q3TX08 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trmt1Q3TX08 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trmt1Q3TX08 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trmt1Q3TX08 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trmt1Q3TX08 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trmt1Q3TX08 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trmt1Q3TX08 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trmt1Q3TX08 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trmt1Q3TX08 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trmt1Q3TX08 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trmt1Q3TX08 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trmt1Q3TX08 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trmt1Q3TX08 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trmt1Q3TX08 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trmt1Q3TX08 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trmt1Q3TX08 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trmt1Q3TX08 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trmt1Q3TX08 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trmt1Q3TX08 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trmt1Q3TX08 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trmt1Q3TX08 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trmt1Q3TX08 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trmt1Q3TX08 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trmt1Q3TX08 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trmt1Q3TX08 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trmt1Q3TX08 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trmt1Q3TX08 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trmt1Q3TX08 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trmt1Q3TX08 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trmt1Q3TX08 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trmt1Q3TX08 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trmt1Q3TX08 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trmt1Q3TX08 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Trmt1Q3TX08 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Trmt1Q3TX08 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Trmt1Q3TX08 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trmt1Q3TX08 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trmt1Q3TX08 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Trmt1Q3TX08 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trmt1Q3TX08 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Trmt1Q3TX08 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trmt1Q3TX08 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trmt1Q3TX08 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trmt1Q3TX08 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trmt1Q3TX08 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trmt1Q3TX08 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trmt1Q3TX08 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trmt1Q3TX08 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trmt1Q3TX08 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trmt1Q3TX08 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trmt1Q3TX08 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trmt1Q3TX08 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trmt1Q3TX08 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trmt1Q3TX08 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Trmt1Q3TX08 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trmt1Q3TX08 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trmt1Q3TX08 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trmt1Q3TX08 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Trmt1Q3TX08 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trmt1Q3TX08 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Trmt1Q3TX08 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trmt1Q3TX08 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trmt1Q3TX08 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trmt1Q3TX08 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trmt1Q3TX08 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trmt1Q3TX08 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trmt1Q3TX08 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trmt1Q3TX08 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trmt1Q3TX08 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms