Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Ctdnep1Q3TP92 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ctdnep1Q3TP92 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ctdnep1Q3TP92 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ctdnep1Q3TP92 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ctdnep1Q3TP92 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ctdnep1Q3TP92 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ctdnep1Q3TP92 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ctdnep1Q3TP92 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ctdnep1Q3TP92 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ctdnep1Q3TP92 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ctdnep1Q3TP92 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Ctdnep1Q3TP92 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ctdnep1Q3TP92 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ctdnep1Q3TP92 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ctdnep1Q3TP92 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ctdnep1Q3TP92 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ctdnep1Q3TP92 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ctdnep1Q3TP92 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ctdnep1Q3TP92 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ctdnep1Q3TP92 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ctdnep1Q3TP92 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ctdnep1Q3TP92 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ctdnep1Q3TP92 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ctdnep1Q3TP92 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ctdnep1Q3TP92 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ctdnep1Q3TP92 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ctdnep1Q3TP92 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ctdnep1Q3TP92 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ctdnep1Q3TP92 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ctdnep1Q3TP92 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ctdnep1Q3TP92 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ctdnep1Q3TP92 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ctdnep1Q3TP92 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ctdnep1Q3TP92 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ctdnep1Q3TP92 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ctdnep1Q3TP92 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ctdnep1Q3TP92 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ctdnep1Q3TP92 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ctdnep1Q3TP92 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ctdnep1Q3TP92 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ctdnep1Q3TP92 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ctdnep1Q3TP92 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ctdnep1Q3TP92 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ctdnep1Q3TP92 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ctdnep1Q3TP92 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ctdnep1Q3TP92 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ctdnep1Q3TP92 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ctdnep1Q3TP92 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ctdnep1Q3TP92 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ctdnep1Q3TP92 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ctdnep1Q3TP92 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ctdnep1Q3TP92 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ctdnep1Q3TP92 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ctdnep1Q3TP92 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ctdnep1Q3TP92 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ctdnep1Q3TP92 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ctdnep1Q3TP92 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ctdnep1Q3TP92 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ctdnep1Q3TP92 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ctdnep1Q3TP92 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ctdnep1Q3TP92 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ctdnep1Q3TP92 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ctdnep1Q3TP92 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ctdnep1Q3TP92 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ctdnep1Q3TP92 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ctdnep1Q3TP92 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ctdnep1Q3TP92 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ctdnep1Q3TP92 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ctdnep1Q3TP92 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ctdnep1Q3TP92 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ctdnep1Q3TP92 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ctdnep1Q3TP92 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ctdnep1Q3TP92 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ctdnep1Q3TP92 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ctdnep1Q3TP92 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ctdnep1Q3TP92 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ctdnep1Q3TP92 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ctdnep1Q3TP92 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ctdnep1Q3TP92 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ctdnep1Q3TP92 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ctdnep1Q3TP92 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ctdnep1Q3TP92 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ctdnep1Q3TP92 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ctdnep1Q3TP92 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ctdnep1Q3TP92 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ctdnep1Q3TP92 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ctdnep1Q3TP92 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ctdnep1Q3TP92 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ctdnep1Q3TP92 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ctdnep1Q3TP92 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ctdnep1Q3TP92 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ctdnep1Q3TP92 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ctdnep1Q3TP92 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ctdnep1Q3TP92 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ctdnep1Q3TP92 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ctdnep1Q3TP92 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Ctdnep1Q3TP92 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Ctdnep1Q3TP92 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ctdnep1Q3TP92 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms