Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
FOXF2Q12947 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
FOXF2Q12947 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
FOXF2Q12947 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
FOXF2Q12947 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
FOXF2Q12947 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
FOXF2Q12947 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
FOXF2Q12947 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
FOXF2Q12947 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
FOXF2Q12947 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
FOXF2Q12947 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
FOXF2Q12947 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
FOXF2Q12947 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
FOXF2Q12947 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
FOXF2Q12947 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
FOXF2Q12947 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
FOXF2Q12947 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
FOXF2Q12947 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
FOXF2Q12947 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
FOXF2Q12947 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
FOXF2Q12947 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
FOXF2Q12947 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
FOXF2Q12947 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
FOXF2Q12947 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
FOXF2Q12947 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
FOXF2Q12947 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
FOXF2Q12947 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
FOXF2Q12947 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
FOXF2Q12947 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
FOXF2Q12947 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
FOXF2Q12947 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
FOXF2Q12947 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
FOXF2Q12947 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
FOXF2Q12947 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
FOXF2Q12947 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
FOXF2Q12947 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
FOXF2Q12947 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
FOXF2Q12947 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
FOXF2Q12947 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
FOXF2Q12947 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
FOXF2Q12947 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
FOXF2Q12947 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
FOXF2Q12947 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
FOXF2Q12947 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
FOXF2Q12947 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
FOXF2Q12947 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
FOXF2Q12947 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
FOXF2Q12947 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
FOXF2Q12947 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
FOXF2Q12947 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
FOXF2Q12947 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
FOXF2Q12947 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
FOXF2Q12947 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
FOXF2Q12947 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
FOXF2Q12947 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
FOXF2Q12947 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
FOXF2Q12947 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
FOXF2Q12947 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
FOXF2Q12947 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
FOXF2Q12947 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
FOXF2Q12947 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
FOXF2Q12947 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
FOXF2Q12947 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
FOXF2Q12947 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
FOXF2Q12947 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
FOXF2Q12947 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
FOXF2Q12947 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
FOXF2Q12947 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
FOXF2Q12947 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
FOXF2Q12947 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
FOXF2Q12947 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
FOXF2Q12947 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
FOXF2Q12947 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
FOXF2Q12947 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
FOXF2Q12947 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
FOXF2Q12947 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
FOXF2Q12947 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
FOXF2Q12947 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
FOXF2Q12947 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
FOXF2Q12947 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
FOXF2Q12947 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
FOXF2Q12947 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
FOXF2Q12947 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
FOXF2Q12947 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
FOXF2Q12947 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
FOXF2Q12947 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
FOXF2Q12947 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
FOXF2Q12947 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
FOXF2Q12947 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
FOXF2Q12947 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
FOXF2Q12947 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
FOXF2Q12947 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
FOXF2Q12947 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
FOXF2Q12947 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
FOXF2Q12947 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
FOXF2Q12947 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
FOXF2Q12947 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
FOXF2Q12947 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
FOXF2Q12947 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
FOXF2Q12947 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
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