Protein–RNA interactions for Protein: Q04887

Sox9, Transcription factor SOX-9, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox9Q04887 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Sox9Q04887 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sox9Q04887 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sox9Q04887 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Sox9Q04887 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Sox9Q04887 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Sox9Q04887 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Sox9Q04887 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sox9Q04887 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Sox9Q04887 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Sox9Q04887 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Sox9Q04887 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Sox9Q04887 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sox9Q04887 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sox9Q04887 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sox9Q04887 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sox9Q04887 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sox9Q04887 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Sox9Q04887 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sox9Q04887 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sox9Q04887 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Sox9Q04887 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Sox9Q04887 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Sox9Q04887 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sox9Q04887 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sox9Q04887 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sox9Q04887 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sox9Q04887 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Sox9Q04887 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sox9Q04887 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sox9Q04887 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sox9Q04887 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sox9Q04887 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sox9Q04887 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sox9Q04887 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sox9Q04887 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sox9Q04887 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sox9Q04887 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sox9Q04887 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sox9Q04887 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sox9Q04887 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sox9Q04887 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sox9Q04887 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sox9Q04887 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sox9Q04887 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sox9Q04887 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Sox9Q04887 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sox9Q04887 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sox9Q04887 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sox9Q04887 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sox9Q04887 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sox9Q04887 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sox9Q04887 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sox9Q04887 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sox9Q04887 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Sox9Q04887 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sox9Q04887 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Sox9Q04887 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sox9Q04887 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sox9Q04887 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sox9Q04887 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sox9Q04887 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sox9Q04887 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sox9Q04887 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sox9Q04887 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sox9Q04887 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sox9Q04887 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sox9Q04887 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sox9Q04887 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sox9Q04887 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sox9Q04887 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sox9Q04887 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Sox9Q04887 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sox9Q04887 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sox9Q04887 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sox9Q04887 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sox9Q04887 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Sox9Q04887 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sox9Q04887 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Sox9Q04887 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sox9Q04887 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sox9Q04887 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sox9Q04887 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sox9Q04887 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sox9Q04887 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sox9Q04887 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sox9Q04887 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sox9Q04887 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sox9Q04887 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Sox9Q04887 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sox9Q04887 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sox9Q04887 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sox9Q04887 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sox9Q04887 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sox9Q04887 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Sox9Q04887 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sox9Q04887 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sox9Q04887 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sox9Q04887 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sox9Q04887 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms