Protein–RNA interactions for Protein: Q00623

Apoa1, Apolipoprotein A-I, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa1Q00623 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Apoa1Q00623 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Apoa1Q00623 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Apoa1Q00623 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Apoa1Q00623 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Apoa1Q00623 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Apoa1Q00623 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Apoa1Q00623 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Apoa1Q00623 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Apoa1Q00623 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Apoa1Q00623 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Apoa1Q00623 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Apoa1Q00623 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Apoa1Q00623 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Apoa1Q00623 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Apoa1Q00623 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Apoa1Q00623 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Apoa1Q00623 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Apoa1Q00623 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Apoa1Q00623 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Apoa1Q00623 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Apoa1Q00623 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Apoa1Q00623 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Apoa1Q00623 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Apoa1Q00623 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Apoa1Q00623 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Apoa1Q00623 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Apoa1Q00623 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Apoa1Q00623 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Apoa1Q00623 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Apoa1Q00623 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Apoa1Q00623 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Apoa1Q00623 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Apoa1Q00623 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Apoa1Q00623 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Apoa1Q00623 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Apoa1Q00623 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Apoa1Q00623 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Apoa1Q00623 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Apoa1Q00623 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Apoa1Q00623 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Apoa1Q00623 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Apoa1Q00623 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Apoa1Q00623 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Apoa1Q00623 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Apoa1Q00623 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Apoa1Q00623 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Apoa1Q00623 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Apoa1Q00623 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Apoa1Q00623 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Apoa1Q00623 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Apoa1Q00623 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Apoa1Q00623 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Apoa1Q00623 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Apoa1Q00623 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Apoa1Q00623 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Apoa1Q00623 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Apoa1Q00623 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Apoa1Q00623 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Apoa1Q00623 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Apoa1Q00623 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Apoa1Q00623 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Apoa1Q00623 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Apoa1Q00623 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Apoa1Q00623 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Apoa1Q00623 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Apoa1Q00623 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Apoa1Q00623 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Apoa1Q00623 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Apoa1Q00623 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Apoa1Q00623 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Apoa1Q00623 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Apoa1Q00623 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Apoa1Q00623 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Apoa1Q00623 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Apoa1Q00623 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Apoa1Q00623 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Apoa1Q00623 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Apoa1Q00623 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Apoa1Q00623 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Apoa1Q00623 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Apoa1Q00623 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Apoa1Q00623 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Apoa1Q00623 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Apoa1Q00623 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Apoa1Q00623 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Apoa1Q00623 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Apoa1Q00623 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Apoa1Q00623 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Apoa1Q00623 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Apoa1Q00623 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Apoa1Q00623 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Apoa1Q00623 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Apoa1Q00623 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Apoa1Q00623 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Apoa1Q00623 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Apoa1Q00623 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Apoa1Q00623 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Apoa1Q00623 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Apoa1Q00623 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms