Protein–RNA interactions for Protein: Q00536

CDK16, Cyclin-dependent kinase 16, humanhuman

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK16Q00536 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CDK16Q00536 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDK16Q00536 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDK16Q00536 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CDK16Q00536 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDK16Q00536 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDK16Q00536 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDK16Q00536 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDK16Q00536 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDK16Q00536 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDK16Q00536 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDK16Q00536 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDK16Q00536 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDK16Q00536 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDK16Q00536 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDK16Q00536 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDK16Q00536 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDK16Q00536 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDK16Q00536 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDK16Q00536 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDK16Q00536 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDK16Q00536 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDK16Q00536 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDK16Q00536 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDK16Q00536 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDK16Q00536 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDK16Q00536 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDK16Q00536 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDK16Q00536 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDK16Q00536 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CDK16Q00536 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CDK16Q00536 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CDK16Q00536 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CDK16Q00536 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CDK16Q00536 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CDK16Q00536 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDK16Q00536 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDK16Q00536 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDK16Q00536 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDK16Q00536 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDK16Q00536 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDK16Q00536 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDK16Q00536 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDK16Q00536 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDK16Q00536 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDK16Q00536 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDK16Q00536 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDK16Q00536 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDK16Q00536 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CDK16Q00536 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDK16Q00536 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDK16Q00536 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDK16Q00536 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDK16Q00536 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDK16Q00536 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDK16Q00536 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDK16Q00536 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDK16Q00536 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDK16Q00536 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDK16Q00536 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDK16Q00536 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CDK16Q00536 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDK16Q00536 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDK16Q00536 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDK16Q00536 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDK16Q00536 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDK16Q00536 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDK16Q00536 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDK16Q00536 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDK16Q00536 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDK16Q00536 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDK16Q00536 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDK16Q00536 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDK16Q00536 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDK16Q00536 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDK16Q00536 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDK16Q00536 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDK16Q00536 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CDK16Q00536 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CDK16Q00536 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CDK16Q00536 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CDK16Q00536 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CDK16Q00536 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CDK16Q00536 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDK16Q00536 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDK16Q00536 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CDK16Q00536 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDK16Q00536 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDK16Q00536 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDK16Q00536 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDK16Q00536 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDK16Q00536 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CDK16Q00536 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDK16Q00536 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDK16Q00536 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDK16Q00536 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDK16Q00536 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDK16Q00536 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDK16Q00536 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CDK16Q00536 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms