Protein–RNA interactions for Protein: P97812

Ihh, Indian hedgehog protein, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IhhP97812 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
IhhP97812 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
IhhP97812 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
IhhP97812 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
IhhP97812 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
IhhP97812 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
IhhP97812 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
IhhP97812 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
IhhP97812 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
IhhP97812 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
IhhP97812 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
IhhP97812 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
IhhP97812 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
IhhP97812 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
IhhP97812 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
IhhP97812 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
IhhP97812 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
IhhP97812 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
IhhP97812 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
IhhP97812 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
IhhP97812 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
IhhP97812 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
IhhP97812 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
IhhP97812 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
IhhP97812 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
IhhP97812 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
IhhP97812 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
IhhP97812 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
IhhP97812 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
IhhP97812 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
IhhP97812 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
IhhP97812 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
IhhP97812 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
IhhP97812 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
IhhP97812 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
IhhP97812 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
IhhP97812 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
IhhP97812 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
IhhP97812 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
IhhP97812 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
IhhP97812 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
IhhP97812 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IhhP97812 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
IhhP97812 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
IhhP97812 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IhhP97812 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IhhP97812 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
IhhP97812 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
IhhP97812 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IhhP97812 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IhhP97812 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IhhP97812 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IhhP97812 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
IhhP97812 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
IhhP97812 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
IhhP97812 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IhhP97812 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
IhhP97812 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IhhP97812 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
IhhP97812 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IhhP97812 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IhhP97812 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IhhP97812 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IhhP97812 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IhhP97812 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IhhP97812 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IhhP97812 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
IhhP97812 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IhhP97812 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IhhP97812 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IhhP97812 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IhhP97812 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IhhP97812 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IhhP97812 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IhhP97812 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IhhP97812 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IhhP97812 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
IhhP97812 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
IhhP97812 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
IhhP97812 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IhhP97812 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IhhP97812 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
IhhP97812 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
IhhP97812 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
IhhP97812 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
IhhP97812 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
IhhP97812 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
IhhP97812 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
IhhP97812 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
IhhP97812 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
IhhP97812 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
IhhP97812 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
IhhP97812 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
IhhP97812 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
IhhP97812 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
IhhP97812 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
IhhP97812 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
IhhP97812 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
IhhP97812 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
IhhP97812 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms