Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Irx1P81068 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Irx1P81068 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Irx1P81068 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Irx1P81068 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Irx1P81068 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Irx1P81068 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Irx1P81068 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Irx1P81068 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Irx1P81068 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Irx1P81068 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Irx1P81068 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Irx1P81068 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Irx1P81068 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Irx1P81068 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Irx1P81068 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Irx1P81068 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Irx1P81068 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Irx1P81068 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Irx1P81068 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Irx1P81068 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Irx1P81068 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Irx1P81068 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Irx1P81068 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Irx1P81068 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Irx1P81068 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Irx1P81068 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Irx1P81068 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Irx1P81068 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Irx1P81068 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Irx1P81068 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Irx1P81068 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Irx1P81068 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Irx1P81068 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Irx1P81068 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Irx1P81068 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Irx1P81068 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Irx1P81068 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Irx1P81068 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Irx1P81068 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Irx1P81068 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Irx1P81068 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Irx1P81068 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Irx1P81068 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Irx1P81068 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Irx1P81068 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Irx1P81068 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Irx1P81068 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Irx1P81068 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Irx1P81068 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Irx1P81068 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Irx1P81068 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Irx1P81068 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Irx1P81068 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Irx1P81068 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Irx1P81068 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Irx1P81068 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Irx1P81068 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Irx1P81068 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Irx1P81068 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Irx1P81068 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Irx1P81068 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Irx1P81068 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Irx1P81068 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Irx1P81068 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Irx1P81068 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Irx1P81068 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Irx1P81068 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Irx1P81068 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Irx1P81068 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Irx1P81068 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Irx1P81068 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Irx1P81068 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Irx1P81068 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Irx1P81068 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Irx1P81068 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Irx1P81068 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Irx1P81068 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Irx1P81068 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Irx1P81068 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Irx1P81068 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Irx1P81068 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Irx1P81068 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Irx1P81068 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Irx1P81068 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Irx1P81068 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Irx1P81068 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Irx1P81068 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Irx1P81068 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Irx1P81068 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Irx1P81068 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Irx1P81068 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Irx1P81068 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Irx1P81068 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Irx1P81068 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Irx1P81068 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Irx1P81068 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Irx1P81068 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Irx1P81068 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Irx1P81068 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.5 ms