Protein–RNA interactions for Protein: P62761

Vsnl1, Visinin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsnl1P62761 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Vsnl1P62761 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vsnl1P62761 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Vsnl1P62761 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vsnl1P62761 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vsnl1P62761 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vsnl1P62761 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vsnl1P62761 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vsnl1P62761 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vsnl1P62761 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vsnl1P62761 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vsnl1P62761 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vsnl1P62761 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vsnl1P62761 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vsnl1P62761 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vsnl1P62761 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vsnl1P62761 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vsnl1P62761 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vsnl1P62761 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vsnl1P62761 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vsnl1P62761 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vsnl1P62761 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vsnl1P62761 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vsnl1P62761 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vsnl1P62761 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vsnl1P62761 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vsnl1P62761 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vsnl1P62761 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vsnl1P62761 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vsnl1P62761 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vsnl1P62761 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vsnl1P62761 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vsnl1P62761 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vsnl1P62761 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vsnl1P62761 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vsnl1P62761 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vsnl1P62761 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vsnl1P62761 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vsnl1P62761 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vsnl1P62761 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vsnl1P62761 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vsnl1P62761 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vsnl1P62761 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vsnl1P62761 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Vsnl1P62761 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Vsnl1P62761 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Vsnl1P62761 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vsnl1P62761 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vsnl1P62761 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vsnl1P62761 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vsnl1P62761 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vsnl1P62761 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vsnl1P62761 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vsnl1P62761 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vsnl1P62761 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vsnl1P62761 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vsnl1P62761 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vsnl1P62761 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vsnl1P62761 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vsnl1P62761 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vsnl1P62761 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Vsnl1P62761 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vsnl1P62761 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vsnl1P62761 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vsnl1P62761 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vsnl1P62761 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vsnl1P62761 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vsnl1P62761 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vsnl1P62761 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vsnl1P62761 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vsnl1P62761 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vsnl1P62761 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vsnl1P62761 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vsnl1P62761 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vsnl1P62761 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vsnl1P62761 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vsnl1P62761 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Vsnl1P62761 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vsnl1P62761 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vsnl1P62761 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vsnl1P62761 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vsnl1P62761 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vsnl1P62761 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vsnl1P62761 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vsnl1P62761 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vsnl1P62761 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vsnl1P62761 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vsnl1P62761 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vsnl1P62761 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vsnl1P62761 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vsnl1P62761 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vsnl1P62761 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vsnl1P62761 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Vsnl1P62761 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vsnl1P62761 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Vsnl1P62761 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vsnl1P62761 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Vsnl1P62761 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Vsnl1P62761 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vsnl1P62761 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms