Protein–RNA interactions for Protein: P59242

Cgn, Cingulin, mousemouse

Predictions only

Length 1,191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CgnP59242 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CgnP59242 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CgnP59242 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CgnP59242 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CgnP59242 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CgnP59242 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CgnP59242 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CgnP59242 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CgnP59242 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CgnP59242 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CgnP59242 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CgnP59242 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CgnP59242 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CgnP59242 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CgnP59242 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CgnP59242 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CgnP59242 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CgnP59242 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CgnP59242 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CgnP59242 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CgnP59242 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CgnP59242 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CgnP59242 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CgnP59242 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CgnP59242 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CgnP59242 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CgnP59242 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CgnP59242 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CgnP59242 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CgnP59242 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CgnP59242 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CgnP59242 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CgnP59242 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CgnP59242 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CgnP59242 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CgnP59242 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CgnP59242 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CgnP59242 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CgnP59242 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CgnP59242 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CgnP59242 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CgnP59242 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CgnP59242 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CgnP59242 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CgnP59242 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CgnP59242 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CgnP59242 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CgnP59242 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CgnP59242 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CgnP59242 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CgnP59242 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CgnP59242 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CgnP59242 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CgnP59242 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CgnP59242 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CgnP59242 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CgnP59242 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CgnP59242 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CgnP59242 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CgnP59242 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CgnP59242 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CgnP59242 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CgnP59242 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CgnP59242 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CgnP59242 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CgnP59242 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CgnP59242 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CgnP59242 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CgnP59242 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CgnP59242 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CgnP59242 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CgnP59242 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CgnP59242 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CgnP59242 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CgnP59242 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CgnP59242 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CgnP59242 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CgnP59242 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CgnP59242 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CgnP59242 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CgnP59242 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CgnP59242 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CgnP59242 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CgnP59242 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CgnP59242 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CgnP59242 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CgnP59242 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CgnP59242 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CgnP59242 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CgnP59242 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CgnP59242 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CgnP59242 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CgnP59242 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CgnP59242 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CgnP59242 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CgnP59242 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CgnP59242 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CgnP59242 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CgnP59242 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CgnP59242 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 204.2 ms