Protein–RNA interactions for Protein: P58466

Ctdsp1, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 1, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp1P58466 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctdsp1P58466 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctdsp1P58466 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctdsp1P58466 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctdsp1P58466 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctdsp1P58466 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctdsp1P58466 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctdsp1P58466 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctdsp1P58466 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctdsp1P58466 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctdsp1P58466 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctdsp1P58466 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ctdsp1P58466 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ctdsp1P58466 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ctdsp1P58466 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ctdsp1P58466 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ctdsp1P58466 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ctdsp1P58466 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ctdsp1P58466 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ctdsp1P58466 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ctdsp1P58466 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ctdsp1P58466 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ctdsp1P58466 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ctdsp1P58466 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ctdsp1P58466 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ctdsp1P58466 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ctdsp1P58466 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ctdsp1P58466 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ctdsp1P58466 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ctdsp1P58466 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ctdsp1P58466 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ctdsp1P58466 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ctdsp1P58466 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ctdsp1P58466 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ctdsp1P58466 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ctdsp1P58466 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ctdsp1P58466 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ctdsp1P58466 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ctdsp1P58466 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ctdsp1P58466 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ctdsp1P58466 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ctdsp1P58466 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ctdsp1P58466 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ctdsp1P58466 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ctdsp1P58466 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ctdsp1P58466 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ctdsp1P58466 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ctdsp1P58466 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ctdsp1P58466 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ctdsp1P58466 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ctdsp1P58466 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ctdsp1P58466 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ctdsp1P58466 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ctdsp1P58466 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ctdsp1P58466 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ctdsp1P58466 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ctdsp1P58466 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctdsp1P58466 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctdsp1P58466 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctdsp1P58466 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctdsp1P58466 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctdsp1P58466 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctdsp1P58466 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctdsp1P58466 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctdsp1P58466 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctdsp1P58466 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctdsp1P58466 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctdsp1P58466 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctdsp1P58466 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctdsp1P58466 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctdsp1P58466 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctdsp1P58466 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctdsp1P58466 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctdsp1P58466 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctdsp1P58466 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctdsp1P58466 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctdsp1P58466 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctdsp1P58466 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctdsp1P58466 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctdsp1P58466 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctdsp1P58466 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctdsp1P58466 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctdsp1P58466 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctdsp1P58466 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctdsp1P58466 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctdsp1P58466 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctdsp1P58466 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctdsp1P58466 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctdsp1P58466 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctdsp1P58466 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctdsp1P58466 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctdsp1P58466 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctdsp1P58466 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctdsp1P58466 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctdsp1P58466 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctdsp1P58466 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctdsp1P58466 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctdsp1P58466 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctdsp1P58466 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctdsp1P58466 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms