Protein–RNA interactions for Protein: P53994

Rab2a, Ras-related protein Rab-2A, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab2aP53994 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab2aP53994 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab2aP53994 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab2aP53994 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab2aP53994 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab2aP53994 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab2aP53994 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab2aP53994 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab2aP53994 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab2aP53994 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab2aP53994 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab2aP53994 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab2aP53994 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab2aP53994 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab2aP53994 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab2aP53994 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab2aP53994 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab2aP53994 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab2aP53994 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab2aP53994 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab2aP53994 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab2aP53994 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab2aP53994 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab2aP53994 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab2aP53994 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab2aP53994 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab2aP53994 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab2aP53994 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab2aP53994 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rab2aP53994 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rab2aP53994 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab2aP53994 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab2aP53994 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab2aP53994 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab2aP53994 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab2aP53994 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab2aP53994 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab2aP53994 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab2aP53994 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab2aP53994 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab2aP53994 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab2aP53994 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab2aP53994 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab2aP53994 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab2aP53994 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab2aP53994 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab2aP53994 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab2aP53994 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab2aP53994 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab2aP53994 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab2aP53994 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab2aP53994 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab2aP53994 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab2aP53994 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab2aP53994 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab2aP53994 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab2aP53994 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab2aP53994 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab2aP53994 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab2aP53994 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab2aP53994 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab2aP53994 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab2aP53994 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab2aP53994 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab2aP53994 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab2aP53994 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab2aP53994 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab2aP53994 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab2aP53994 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab2aP53994 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab2aP53994 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab2aP53994 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab2aP53994 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab2aP53994 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab2aP53994 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab2aP53994 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab2aP53994 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab2aP53994 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab2aP53994 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab2aP53994 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab2aP53994 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab2aP53994 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab2aP53994 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab2aP53994 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab2aP53994 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab2aP53994 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab2aP53994 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab2aP53994 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab2aP53994 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab2aP53994 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab2aP53994 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab2aP53994 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab2aP53994 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab2aP53994 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab2aP53994 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab2aP53994 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab2aP53994 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab2aP53994 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab2aP53994 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab2aP53994 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms