Protein–RNA interactions for Protein: P52432

Polr1c, DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1cP52432 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Polr1cP52432 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Polr1cP52432 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Polr1cP52432 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Polr1cP52432 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Polr1cP52432 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Polr1cP52432 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Polr1cP52432 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Polr1cP52432 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Polr1cP52432 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Polr1cP52432 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Polr1cP52432 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Polr1cP52432 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Polr1cP52432 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Polr1cP52432 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Polr1cP52432 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Polr1cP52432 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Polr1cP52432 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Polr1cP52432 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Polr1cP52432 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Polr1cP52432 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Polr1cP52432 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Polr1cP52432 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Polr1cP52432 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Polr1cP52432 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Polr1cP52432 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Polr1cP52432 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Polr1cP52432 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Polr1cP52432 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Polr1cP52432 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Polr1cP52432 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Polr1cP52432 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Polr1cP52432 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Polr1cP52432 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Polr1cP52432 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Polr1cP52432 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Polr1cP52432 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Polr1cP52432 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Polr1cP52432 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Polr1cP52432 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Polr1cP52432 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Polr1cP52432 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Polr1cP52432 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Polr1cP52432 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Polr1cP52432 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Polr1cP52432 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Polr1cP52432 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Polr1cP52432 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Polr1cP52432 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Polr1cP52432 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Polr1cP52432 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Polr1cP52432 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Polr1cP52432 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Polr1cP52432 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Polr1cP52432 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Polr1cP52432 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Polr1cP52432 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Polr1cP52432 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Polr1cP52432 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Polr1cP52432 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Polr1cP52432 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Polr1cP52432 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Polr1cP52432 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Polr1cP52432 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Polr1cP52432 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Polr1cP52432 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Polr1cP52432 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Polr1cP52432 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Polr1cP52432 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Polr1cP52432 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Polr1cP52432 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Polr1cP52432 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Polr1cP52432 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Polr1cP52432 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Polr1cP52432 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Polr1cP52432 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Polr1cP52432 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Polr1cP52432 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Polr1cP52432 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Polr1cP52432 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Polr1cP52432 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Polr1cP52432 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Polr1cP52432 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Polr1cP52432 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Polr1cP52432 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Polr1cP52432 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Polr1cP52432 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Polr1cP52432 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Polr1cP52432 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Polr1cP52432 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Polr1cP52432 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Polr1cP52432 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Polr1cP52432 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Polr1cP52432 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Polr1cP52432 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Polr1cP52432 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Polr1cP52432 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Polr1cP52432 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Polr1cP52432 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Polr1cP52432 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms