Protein–RNA interactions for Protein: P51801

CLCNKB, Chloride channel protein ClC-Kb, humanhuman

Predictions only

Length 687 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCNKBP51801 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLCNKBP51801 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLCNKBP51801 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLCNKBP51801 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLCNKBP51801 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLCNKBP51801 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLCNKBP51801 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLCNKBP51801 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLCNKBP51801 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLCNKBP51801 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLCNKBP51801 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLCNKBP51801 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLCNKBP51801 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLCNKBP51801 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLCNKBP51801 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLCNKBP51801 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLCNKBP51801 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLCNKBP51801 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLCNKBP51801 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLCNKBP51801 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLCNKBP51801 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLCNKBP51801 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLCNKBP51801 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLCNKBP51801 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLCNKBP51801 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLCNKBP51801 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLCNKBP51801 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLCNKBP51801 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CLCNKBP51801 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLCNKBP51801 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLCNKBP51801 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLCNKBP51801 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLCNKBP51801 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CLCNKBP51801 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CLCNKBP51801 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CLCNKBP51801 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CLCNKBP51801 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CLCNKBP51801 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLCNKBP51801 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CLCNKBP51801 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLCNKBP51801 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLCNKBP51801 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLCNKBP51801 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLCNKBP51801 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLCNKBP51801 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLCNKBP51801 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLCNKBP51801 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLCNKBP51801 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CLCNKBP51801 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CLCNKBP51801 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CLCNKBP51801 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CLCNKBP51801 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CLCNKBP51801 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CLCNKBP51801 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLCNKBP51801 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLCNKBP51801 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLCNKBP51801 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLCNKBP51801 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLCNKBP51801 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLCNKBP51801 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLCNKBP51801 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLCNKBP51801 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLCNKBP51801 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLCNKBP51801 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLCNKBP51801 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLCNKBP51801 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLCNKBP51801 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLCNKBP51801 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLCNKBP51801 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CLCNKBP51801 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLCNKBP51801 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CLCNKBP51801 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLCNKBP51801 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLCNKBP51801 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLCNKBP51801 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CLCNKBP51801 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLCNKBP51801 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLCNKBP51801 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLCNKBP51801 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLCNKBP51801 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLCNKBP51801 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLCNKBP51801 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLCNKBP51801 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CLCNKBP51801 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLCNKBP51801 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLCNKBP51801 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLCNKBP51801 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLCNKBP51801 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLCNKBP51801 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLCNKBP51801 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLCNKBP51801 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLCNKBP51801 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLCNKBP51801 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLCNKBP51801 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLCNKBP51801 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLCNKBP51801 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLCNKBP51801 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLCNKBP51801 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLCNKBP51801 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLCNKBP51801 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms