Protein–RNA interactions for Protein: P43276

Hist1h1b, Histone H1.5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 223 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hist1h1bP43276 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hist1h1bP43276 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hist1h1bP43276 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hist1h1bP43276 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hist1h1bP43276 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hist1h1bP43276 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hist1h1bP43276 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hist1h1bP43276 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hist1h1bP43276 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hist1h1bP43276 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hist1h1bP43276 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hist1h1bP43276 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hist1h1bP43276 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hist1h1bP43276 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hist1h1bP43276 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hist1h1bP43276 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hist1h1bP43276 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hist1h1bP43276 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hist1h1bP43276 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hist1h1bP43276 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hist1h1bP43276 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hist1h1bP43276 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hist1h1bP43276 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hist1h1bP43276 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hist1h1bP43276 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hist1h1bP43276 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hist1h1bP43276 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hist1h1bP43276 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hist1h1bP43276 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hist1h1bP43276 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Hist1h1bP43276 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hist1h1bP43276 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hist1h1bP43276 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hist1h1bP43276 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Hist1h1bP43276 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hist1h1bP43276 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hist1h1bP43276 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hist1h1bP43276 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hist1h1bP43276 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hist1h1bP43276 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hist1h1bP43276 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hist1h1bP43276 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hist1h1bP43276 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hist1h1bP43276 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hist1h1bP43276 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hist1h1bP43276 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hist1h1bP43276 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hist1h1bP43276 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hist1h1bP43276 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hist1h1bP43276 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hist1h1bP43276 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hist1h1bP43276 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Hist1h1bP43276 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hist1h1bP43276 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Hist1h1bP43276 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hist1h1bP43276 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hist1h1bP43276 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hist1h1bP43276 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hist1h1bP43276 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hist1h1bP43276 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Hist1h1bP43276 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hist1h1bP43276 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hist1h1bP43276 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hist1h1bP43276 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hist1h1bP43276 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hist1h1bP43276 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hist1h1bP43276 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hist1h1bP43276 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hist1h1bP43276 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Hist1h1bP43276 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Hist1h1bP43276 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Hist1h1bP43276 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hist1h1bP43276 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hist1h1bP43276 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hist1h1bP43276 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hist1h1bP43276 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hist1h1bP43276 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Hist1h1bP43276 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hist1h1bP43276 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hist1h1bP43276 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hist1h1bP43276 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hist1h1bP43276 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hist1h1bP43276 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hist1h1bP43276 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hist1h1bP43276 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hist1h1bP43276 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hist1h1bP43276 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hist1h1bP43276 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hist1h1bP43276 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hist1h1bP43276 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hist1h1bP43276 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Hist1h1bP43276 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hist1h1bP43276 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hist1h1bP43276 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hist1h1bP43276 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hist1h1bP43276 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hist1h1bP43276 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hist1h1bP43276 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hist1h1bP43276 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hist1h1bP43276 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms