Protein–RNA interactions for Protein: P39061

Col18a1, Collagen alpha-1(XVIII) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col18a1P39061 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Col18a1P39061 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Col18a1P39061 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Col18a1P39061 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Col18a1P39061 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Col18a1P39061 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Col18a1P39061 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
Col18a1P39061 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Col18a1P39061 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Col18a1P39061 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Col18a1P39061 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Col18a1P39061 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Col18a1P39061 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Col18a1P39061 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Col18a1P39061 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Col18a1P39061 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Col18a1P39061 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Col18a1P39061 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Col18a1P39061 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Col18a1P39061 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Col18a1P39061 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Col18a1P39061 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Col18a1P39061 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Col18a1P39061 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Col18a1P39061 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Col18a1P39061 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Col18a1P39061 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Col18a1P39061 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Col18a1P39061 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Col18a1P39061 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Col18a1P39061 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Col18a1P39061 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Col18a1P39061 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Col18a1P39061 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Col18a1P39061 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Col18a1P39061 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Col18a1P39061 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Col18a1P39061 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Col18a1P39061 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Col18a1P39061 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Col18a1P39061 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Col18a1P39061 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Col18a1P39061 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Col18a1P39061 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Col18a1P39061 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Col18a1P39061 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Col18a1P39061 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Col18a1P39061 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Col18a1P39061 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Col18a1P39061 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Col18a1P39061 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Col18a1P39061 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Col18a1P39061 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Col18a1P39061 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Col18a1P39061 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Col18a1P39061 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Col18a1P39061 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Col18a1P39061 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Col18a1P39061 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Col18a1P39061 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Col18a1P39061 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Col18a1P39061 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Col18a1P39061 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Col18a1P39061 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Col18a1P39061 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Col18a1P39061 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Col18a1P39061 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Col18a1P39061 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Col18a1P39061 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Col18a1P39061 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Col18a1P39061 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Col18a1P39061 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Col18a1P39061 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Col18a1P39061 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Col18a1P39061 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Col18a1P39061 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Col18a1P39061 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Col18a1P39061 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Col18a1P39061 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Col18a1P39061 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Col18a1P39061 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Col18a1P39061 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Col18a1P39061 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Col18a1P39061 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Col18a1P39061 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Col18a1P39061 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Col18a1P39061 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Col18a1P39061 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Col18a1P39061 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Col18a1P39061 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Col18a1P39061 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Col18a1P39061 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Col18a1P39061 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Col18a1P39061 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Col18a1P39061 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Col18a1P39061 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Col18a1P39061 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Col18a1P39061 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Col18a1P39061 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Col18a1P39061 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms