Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hoxc11P31313 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hoxc11P31313 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hoxc11P31313 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxc11P31313 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxc11P31313 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxc11P31313 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxc11P31313 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxc11P31313 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxc11P31313 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxc11P31313 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxc11P31313 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxc11P31313 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxc11P31313 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxc11P31313 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxc11P31313 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxc11P31313 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxc11P31313 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxc11P31313 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxc11P31313 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxc11P31313 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxc11P31313 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxc11P31313 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxc11P31313 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxc11P31313 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxc11P31313 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxc11P31313 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxc11P31313 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxc11P31313 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxc11P31313 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxc11P31313 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxc11P31313 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxc11P31313 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxc11P31313 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxc11P31313 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxc11P31313 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxc11P31313 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxc11P31313 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxc11P31313 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxc11P31313 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxc11P31313 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxc11P31313 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxc11P31313 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxc11P31313 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxc11P31313 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxc11P31313 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxc11P31313 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxc11P31313 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxc11P31313 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxc11P31313 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxc11P31313 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Hoxc11P31313 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Hoxc11P31313 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Hoxc11P31313 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Hoxc11P31313 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Hoxc11P31313 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Hoxc11P31313 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hoxc11P31313 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hoxc11P31313 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hoxc11P31313 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hoxc11P31313 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hoxc11P31313 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hoxc11P31313 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hoxc11P31313 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hoxc11P31313 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hoxc11P31313 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hoxc11P31313 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxc11P31313 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxc11P31313 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxc11P31313 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxc11P31313 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxc11P31313 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxc11P31313 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxc11P31313 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxc11P31313 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxc11P31313 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxc11P31313 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxc11P31313 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxc11P31313 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxc11P31313 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxc11P31313 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxc11P31313 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxc11P31313 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxc11P31313 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxc11P31313 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxc11P31313 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxc11P31313 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxc11P31313 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxc11P31313 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxc11P31313 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxc11P31313 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxc11P31313 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxc11P31313 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxc11P31313 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxc11P31313 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxc11P31313 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxc11P31313 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxc11P31313 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxc11P31313 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxc11P31313 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms