Protein–RNA interactions for Protein: P31270

HOXA11, Homeobox protein Hox-A11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA11P31270 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
HOXA11P31270 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HOXA11P31270 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HOXA11P31270 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HOXA11P31270 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HOXA11P31270 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HOXA11P31270 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HOXA11P31270 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HOXA11P31270 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
HOXA11P31270 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HOXA11P31270 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HOXA11P31270 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HOXA11P31270 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HOXA11P31270 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HOXA11P31270 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HOXA11P31270 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HOXA11P31270 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HOXA11P31270 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HOXA11P31270 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HOXA11P31270 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
HOXA11P31270 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HOXA11P31270 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HOXA11P31270 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
HOXA11P31270 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HOXA11P31270 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HOXA11P31270 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HOXA11P31270 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HOXA11P31270 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
HOXA11P31270 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HOXA11P31270 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HOXA11P31270 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HOXA11P31270 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HOXA11P31270 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HOXA11P31270 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HOXA11P31270 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HOXA11P31270 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HOXA11P31270 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HOXA11P31270 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HOXA11P31270 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
HOXA11P31270 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HOXA11P31270 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HOXA11P31270 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HOXA11P31270 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HOXA11P31270 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HOXA11P31270 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HOXA11P31270 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HOXA11P31270 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HOXA11P31270 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HOXA11P31270 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HOXA11P31270 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
HOXA11P31270 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HOXA11P31270 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HOXA11P31270 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HOXA11P31270 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HOXA11P31270 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HOXA11P31270 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HOXA11P31270 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HOXA11P31270 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HOXA11P31270 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HOXA11P31270 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HOXA11P31270 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HOXA11P31270 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HOXA11P31270 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HOXA11P31270 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HOXA11P31270 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HOXA11P31270 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HOXA11P31270 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HOXA11P31270 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HOXA11P31270 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HOXA11P31270 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
HOXA11P31270 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HOXA11P31270 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HOXA11P31270 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
HOXA11P31270 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
HOXA11P31270 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
HOXA11P31270 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HOXA11P31270 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
HOXA11P31270 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HOXA11P31270 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HOXA11P31270 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HOXA11P31270 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HOXA11P31270 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HOXA11P31270 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HOXA11P31270 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
HOXA11P31270 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HOXA11P31270 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HOXA11P31270 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HOXA11P31270 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HOXA11P31270 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HOXA11P31270 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HOXA11P31270 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HOXA11P31270 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HOXA11P31270 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HOXA11P31270 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
HOXA11P31270 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HOXA11P31270 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HOXA11P31270 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HOXA11P31270 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HOXA11P31270 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HOXA11P31270 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms