Protein–RNA interactions for Protein: P30658

Cbx2, Chromobox protein homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx2P30658 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cbx2P30658 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cbx2P30658 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cbx2P30658 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cbx2P30658 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cbx2P30658 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cbx2P30658 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cbx2P30658 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cbx2P30658 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cbx2P30658 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cbx2P30658 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cbx2P30658 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Cbx2P30658 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Cbx2P30658 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cbx2P30658 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cbx2P30658 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cbx2P30658 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cbx2P30658 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Cbx2P30658 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Cbx2P30658 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Cbx2P30658 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Cbx2P30658 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Cbx2P30658 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Cbx2P30658 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cbx2P30658 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cbx2P30658 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cbx2P30658 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cbx2P30658 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cbx2P30658 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cbx2P30658 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cbx2P30658 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cbx2P30658 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Cbx2P30658 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Cbx2P30658 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cbx2P30658 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cbx2P30658 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cbx2P30658 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cbx2P30658 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cbx2P30658 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cbx2P30658 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cbx2P30658 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cbx2P30658 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cbx2P30658 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cbx2P30658 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cbx2P30658 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cbx2P30658 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cbx2P30658 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cbx2P30658 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cbx2P30658 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cbx2P30658 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cbx2P30658 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cbx2P30658 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cbx2P30658 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cbx2P30658 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Cbx2P30658 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cbx2P30658 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cbx2P30658 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cbx2P30658 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cbx2P30658 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cbx2P30658 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cbx2P30658 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cbx2P30658 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cbx2P30658 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cbx2P30658 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Cbx2P30658 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cbx2P30658 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cbx2P30658 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cbx2P30658 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cbx2P30658 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Cbx2P30658 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cbx2P30658 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cbx2P30658 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cbx2P30658 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cbx2P30658 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cbx2P30658 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cbx2P30658 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cbx2P30658 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cbx2P30658 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cbx2P30658 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cbx2P30658 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cbx2P30658 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cbx2P30658 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cbx2P30658 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Cbx2P30658 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cbx2P30658 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cbx2P30658 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cbx2P30658 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Cbx2P30658 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cbx2P30658 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cbx2P30658 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cbx2P30658 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cbx2P30658 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cbx2P30658 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cbx2P30658 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cbx2P30658 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cbx2P30658 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cbx2P30658 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cbx2P30658 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cbx2P30658 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cbx2P30658 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms