Protein–RNA interactions for Protein: P18850

ATF6, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-6 alpha, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF6P18850 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATF6P18850 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ATF6P18850 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATF6P18850 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATF6P18850 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ATF6P18850 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATF6P18850 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATF6P18850 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATF6P18850 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATF6P18850 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ATF6P18850 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATF6P18850 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATF6P18850 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATF6P18850 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATF6P18850 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATF6P18850 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATF6P18850 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATF6P18850 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATF6P18850 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATF6P18850 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATF6P18850 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATF6P18850 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATF6P18850 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATF6P18850 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATF6P18850 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATF6P18850 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATF6P18850 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATF6P18850 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATF6P18850 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATF6P18850 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATF6P18850 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATF6P18850 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATF6P18850 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATF6P18850 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATF6P18850 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATF6P18850 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATF6P18850 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATF6P18850 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATF6P18850 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATF6P18850 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATF6P18850 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATF6P18850 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATF6P18850 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATF6P18850 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATF6P18850 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATF6P18850 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATF6P18850 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATF6P18850 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATF6P18850 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATF6P18850 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
ATF6P18850 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATF6P18850 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATF6P18850 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATF6P18850 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATF6P18850 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATF6P18850 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATF6P18850 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATF6P18850 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATF6P18850 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATF6P18850 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATF6P18850 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATF6P18850 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATF6P18850 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATF6P18850 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATF6P18850 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATF6P18850 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATF6P18850 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATF6P18850 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATF6P18850 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATF6P18850 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATF6P18850 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATF6P18850 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATF6P18850 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATF6P18850 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATF6P18850 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATF6P18850 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATF6P18850 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATF6P18850 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ATF6P18850 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATF6P18850 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATF6P18850 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATF6P18850 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATF6P18850 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATF6P18850 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATF6P18850 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATF6P18850 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ATF6P18850 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATF6P18850 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATF6P18850 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATF6P18850 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATF6P18850 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATF6P18850 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATF6P18850 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATF6P18850 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATF6P18850 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATF6P18850 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATF6P18850 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATF6P18850 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATF6P18850 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATF6P18850 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms