Protein–RNA interactions for Protein: P10400

Pol, Retrovirus-related Pol polyprotein (Fragment), mousemouse

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Length 120 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolP10400 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PolP10400 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PolP10400 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
PolP10400 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
PolP10400 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PolP10400 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PolP10400 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PolP10400 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PolP10400 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
PolP10400 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PolP10400 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PolP10400 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PolP10400 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PolP10400 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PolP10400 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PolP10400 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PolP10400 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PolP10400 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PolP10400 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PolP10400 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PolP10400 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
PolP10400 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PolP10400 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PolP10400 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PolP10400 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PolP10400 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PolP10400 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PolP10400 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PolP10400 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PolP10400 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PolP10400 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PolP10400 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PolP10400 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PolP10400 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PolP10400 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PolP10400 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PolP10400 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PolP10400 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PolP10400 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PolP10400 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PolP10400 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PolP10400 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PolP10400 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
PolP10400 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PolP10400 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PolP10400 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PolP10400 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PolP10400 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PolP10400 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PolP10400 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PolP10400 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PolP10400 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PolP10400 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PolP10400 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PolP10400 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PolP10400 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
PolP10400 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PolP10400 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PolP10400 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PolP10400 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
PolP10400 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PolP10400 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PolP10400 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PolP10400 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PolP10400 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PolP10400 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PolP10400 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PolP10400 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PolP10400 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PolP10400 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PolP10400 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PolP10400 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PolP10400 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PolP10400 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PolP10400 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PolP10400 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PolP10400 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PolP10400 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PolP10400 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PolP10400 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PolP10400 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PolP10400 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PolP10400 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PolP10400 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PolP10400 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PolP10400 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PolP10400 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PolP10400 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PolP10400 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PolP10400 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PolP10400 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PolP10400 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PolP10400 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PolP10400 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PolP10400 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PolP10400 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PolP10400 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PolP10400 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PolP10400 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PolP10400 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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