Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

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Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
PTPRCP08575 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PTPRCP08575 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PTPRCP08575 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PTPRCP08575 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PTPRCP08575 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PTPRCP08575 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PTPRCP08575 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PTPRCP08575 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PTPRCP08575 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PTPRCP08575 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PTPRCP08575 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
PTPRCP08575 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
PTPRCP08575 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PTPRCP08575 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PTPRCP08575 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PTPRCP08575 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PTPRCP08575 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PTPRCP08575 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PTPRCP08575 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PTPRCP08575 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PTPRCP08575 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PTPRCP08575 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PTPRCP08575 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PTPRCP08575 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PTPRCP08575 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PTPRCP08575 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PTPRCP08575 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PTPRCP08575 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PTPRCP08575 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PTPRCP08575 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PTPRCP08575 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
PTPRCP08575 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PTPRCP08575 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PTPRCP08575 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PTPRCP08575 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PTPRCP08575 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PTPRCP08575 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PTPRCP08575 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PTPRCP08575 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PTPRCP08575 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PTPRCP08575 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PTPRCP08575 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PTPRCP08575 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PTPRCP08575 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
PTPRCP08575 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PTPRCP08575 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PTPRCP08575 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PTPRCP08575 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PTPRCP08575 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PTPRCP08575 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PTPRCP08575 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PTPRCP08575 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PTPRCP08575 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
PTPRCP08575 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PTPRCP08575 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2
PTPRCP08575 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2
PTPRCP08575 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC27.58■■■□□ 2
PTPRCP08575 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PTPRCP08575 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
PTPRCP08575 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PTPRCP08575 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
PTPRCP08575 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
PTPRCP08575 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PTPRCP08575 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PTPRCP08575 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PTPRCP08575 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
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PTPRCP08575 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
PTPRCP08575 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC27.57■■■□□ 2
PTPRCP08575 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PTPRCP08575 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
PTPRCP08575 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
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PTPRCP08575 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
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PTPRCP08575 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
PTPRCP08575 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC27.56■■■□□ 2
PTPRCP08575 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
PTPRCP08575 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC27.56■■■□□ 2
PTPRCP08575 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PTPRCP08575 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PTPRCP08575 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PTPRCP08575 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
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PTPRCP08575 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PTPRCP08575 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PTPRCP08575 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PTPRCP08575 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PTPRCP08575 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PTPRCP08575 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PTPRCP08575 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PTPRCP08575 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
PTPRCP08575 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
PTPRCP08575 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PTPRCP08575 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
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