Protein–RNA interactions for Protein: P01728

Ig lambda-2 chain V region, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01728 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01728 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01728 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01728 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01728 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01728 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01728 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01728 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01728 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01728 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01728 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01728 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01728 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01728 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01728 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01728 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01728 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01728 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01728 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01728 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01728 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01728 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
P01728 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01728 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01728 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01728 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01728 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01728 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01728 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01728 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01728 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01728 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01728 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01728 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01728 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01728 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
P01728 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01728 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01728 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01728 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01728 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01728 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01728 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01728 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01728 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01728 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01728 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01728 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01728 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01728 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01728 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01728 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01728 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01728 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01728 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01728 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01728 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01728 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
P01728 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01728 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01728 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01728 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01728 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01728 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01728 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
P01728 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01728 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01728 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01728 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01728 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
P01728 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01728 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01728 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01728 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01728 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01728 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01728 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01728 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01728 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01728 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01728 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01728 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01728 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01728 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01728 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01728 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
P01728 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
P01728 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01728 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01728 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01728 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01728 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01728 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01728 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01728 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01728 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01728 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01728 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01728 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01728 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms