Protein–RNA interactions for Protein: P01572

Ifna1, Interferon alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna1P01572 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ifna1P01572 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ifna1P01572 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ifna1P01572 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ifna1P01572 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ifna1P01572 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ifna1P01572 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ifna1P01572 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ifna1P01572 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ifna1P01572 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ifna1P01572 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ifna1P01572 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ifna1P01572 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ifna1P01572 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ifna1P01572 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ifna1P01572 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ifna1P01572 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ifna1P01572 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ifna1P01572 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ifna1P01572 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ifna1P01572 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ifna1P01572 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ifna1P01572 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ifna1P01572 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ifna1P01572 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ifna1P01572 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ifna1P01572 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ifna1P01572 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ifna1P01572 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ifna1P01572 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ifna1P01572 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ifna1P01572 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ifna1P01572 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ifna1P01572 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ifna1P01572 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ifna1P01572 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ifna1P01572 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ifna1P01572 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ifna1P01572 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ifna1P01572 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ifna1P01572 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ifna1P01572 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ifna1P01572 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ifna1P01572 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ifna1P01572 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ifna1P01572 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ifna1P01572 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ifna1P01572 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ifna1P01572 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ifna1P01572 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ifna1P01572 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ifna1P01572 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ifna1P01572 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ifna1P01572 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ifna1P01572 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ifna1P01572 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ifna1P01572 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ifna1P01572 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ifna1P01572 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ifna1P01572 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ifna1P01572 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ifna1P01572 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ifna1P01572 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ifna1P01572 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ifna1P01572 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ifna1P01572 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ifna1P01572 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ifna1P01572 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ifna1P01572 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ifna1P01572 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ifna1P01572 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ifna1P01572 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ifna1P01572 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ifna1P01572 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ifna1P01572 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ifna1P01572 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ifna1P01572 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ifna1P01572 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ifna1P01572 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ifna1P01572 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ifna1P01572 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ifna1P01572 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ifna1P01572 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ifna1P01572 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ifna1P01572 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ifna1P01572 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ifna1P01572 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ifna1P01572 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ifna1P01572 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ifna1P01572 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ifna1P01572 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ifna1P01572 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ifna1P01572 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ifna1P01572 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ifna1P01572 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ifna1P01572 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ifna1P01572 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ifna1P01572 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ifna1P01572 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ifna1P01572 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms