Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccl20O89093 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccl20O89093 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccl20O89093 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccl20O89093 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccl20O89093 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccl20O89093 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccl20O89093 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccl20O89093 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccl20O89093 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccl20O89093 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccl20O89093 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccl20O89093 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccl20O89093 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccl20O89093 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccl20O89093 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccl20O89093 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccl20O89093 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccl20O89093 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccl20O89093 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccl20O89093 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccl20O89093 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccl20O89093 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccl20O89093 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccl20O89093 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccl20O89093 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccl20O89093 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccl20O89093 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccl20O89093 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccl20O89093 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccl20O89093 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccl20O89093 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccl20O89093 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccl20O89093 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccl20O89093 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccl20O89093 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccl20O89093 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccl20O89093 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccl20O89093 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccl20O89093 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccl20O89093 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccl20O89093 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccl20O89093 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccl20O89093 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccl20O89093 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccl20O89093 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccl20O89093 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccl20O89093 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccl20O89093 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccl20O89093 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccl20O89093 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccl20O89093 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccl20O89093 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccl20O89093 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccl20O89093 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccl20O89093 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccl20O89093 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccl20O89093 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccl20O89093 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccl20O89093 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccl20O89093 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccl20O89093 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
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Ccl20O89093 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccl20O89093 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccl20O89093 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccl20O89093 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccl20O89093 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccl20O89093 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccl20O89093 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccl20O89093 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccl20O89093 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccl20O89093 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccl20O89093 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccl20O89093 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccl20O89093 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccl20O89093 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccl20O89093 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccl20O89093 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccl20O89093 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccl20O89093 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccl20O89093 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccl20O89093 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccl20O89093 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccl20O89093 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccl20O89093 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccl20O89093 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccl20O89093 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccl20O89093 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccl20O89093 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccl20O89093 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccl20O89093 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccl20O89093 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccl20O89093 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccl20O89093 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccl20O89093 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccl20O89093 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccl20O89093 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccl20O89093 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccl20O89093 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
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