Protein–RNA interactions for Protein: O88824

Jtb, Protein JTB, mousemouse

Predictions only

Length 146 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JtbO88824 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
JtbO88824 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
JtbO88824 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
JtbO88824 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
JtbO88824 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
JtbO88824 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
JtbO88824 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
JtbO88824 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
JtbO88824 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
JtbO88824 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
JtbO88824 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
JtbO88824 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
JtbO88824 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
JtbO88824 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
JtbO88824 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
JtbO88824 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
JtbO88824 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
JtbO88824 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
JtbO88824 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
JtbO88824 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
JtbO88824 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
JtbO88824 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
JtbO88824 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
JtbO88824 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
JtbO88824 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
JtbO88824 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
JtbO88824 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
JtbO88824 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
JtbO88824 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
JtbO88824 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
JtbO88824 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
JtbO88824 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
JtbO88824 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
JtbO88824 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
JtbO88824 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
JtbO88824 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
JtbO88824 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
JtbO88824 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
JtbO88824 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
JtbO88824 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
JtbO88824 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
JtbO88824 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
JtbO88824 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
JtbO88824 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
JtbO88824 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
JtbO88824 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
JtbO88824 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
JtbO88824 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
JtbO88824 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
JtbO88824 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
JtbO88824 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
JtbO88824 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
JtbO88824 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
JtbO88824 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
JtbO88824 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
JtbO88824 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
JtbO88824 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
JtbO88824 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
JtbO88824 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
JtbO88824 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
JtbO88824 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
JtbO88824 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
JtbO88824 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
JtbO88824 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
JtbO88824 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
JtbO88824 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
JtbO88824 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
JtbO88824 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
JtbO88824 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
JtbO88824 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
JtbO88824 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
JtbO88824 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
JtbO88824 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
JtbO88824 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
JtbO88824 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
JtbO88824 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
JtbO88824 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
JtbO88824 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
JtbO88824 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
JtbO88824 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
JtbO88824 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
JtbO88824 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
JtbO88824 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
JtbO88824 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
JtbO88824 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
JtbO88824 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
JtbO88824 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
JtbO88824 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
JtbO88824 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
JtbO88824 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
JtbO88824 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
JtbO88824 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
JtbO88824 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
JtbO88824 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
JtbO88824 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
JtbO88824 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
JtbO88824 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
JtbO88824 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
JtbO88824 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
JtbO88824 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms