Protein–RNA interactions for Protein: O55103

Prx, Periaxin, mousemouse

Predictions only

Length 1,391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrxO55103 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PrxO55103 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PrxO55103 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PrxO55103 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PrxO55103 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PrxO55103 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PrxO55103 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PrxO55103 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PrxO55103 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
PrxO55103 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PrxO55103 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PrxO55103 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PrxO55103 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PrxO55103 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PrxO55103 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PrxO55103 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PrxO55103 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PrxO55103 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PrxO55103 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PrxO55103 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PrxO55103 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PrxO55103 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PrxO55103 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PrxO55103 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PrxO55103 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PrxO55103 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PrxO55103 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PrxO55103 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PrxO55103 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
PrxO55103 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PrxO55103 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PrxO55103 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PrxO55103 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PrxO55103 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PrxO55103 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PrxO55103 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PrxO55103 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PrxO55103 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PrxO55103 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PrxO55103 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PrxO55103 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PrxO55103 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
PrxO55103 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PrxO55103 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PrxO55103 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PrxO55103 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PrxO55103 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
PrxO55103 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PrxO55103 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
PrxO55103 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PrxO55103 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PrxO55103 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PrxO55103 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PrxO55103 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PrxO55103 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PrxO55103 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PrxO55103 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PrxO55103 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PrxO55103 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PrxO55103 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PrxO55103 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PrxO55103 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PrxO55103 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PrxO55103 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PrxO55103 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PrxO55103 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PrxO55103 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PrxO55103 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PrxO55103 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PrxO55103 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PrxO55103 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
PrxO55103 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PrxO55103 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PrxO55103 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PrxO55103 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PrxO55103 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PrxO55103 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PrxO55103 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PrxO55103 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
PrxO55103 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PrxO55103 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PrxO55103 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PrxO55103 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PrxO55103 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PrxO55103 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PrxO55103 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PrxO55103 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PrxO55103 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PrxO55103 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PrxO55103 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PrxO55103 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PrxO55103 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PrxO55103 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PrxO55103 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PrxO55103 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PrxO55103 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PrxO55103 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
PrxO55103 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PrxO55103 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PrxO55103 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms