Protein–RNA interactions for Protein: O55101

Syngr2, Synaptogyrin-2, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngr2O55101 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Syngr2O55101 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syngr2O55101 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syngr2O55101 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syngr2O55101 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syngr2O55101 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Syngr2O55101 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syngr2O55101 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syngr2O55101 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syngr2O55101 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syngr2O55101 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syngr2O55101 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syngr2O55101 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syngr2O55101 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syngr2O55101 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syngr2O55101 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syngr2O55101 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syngr2O55101 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syngr2O55101 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syngr2O55101 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syngr2O55101 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syngr2O55101 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Syngr2O55101 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Syngr2O55101 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syngr2O55101 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syngr2O55101 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syngr2O55101 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syngr2O55101 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syngr2O55101 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syngr2O55101 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syngr2O55101 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syngr2O55101 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syngr2O55101 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syngr2O55101 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syngr2O55101 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syngr2O55101 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syngr2O55101 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syngr2O55101 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syngr2O55101 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syngr2O55101 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syngr2O55101 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syngr2O55101 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syngr2O55101 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syngr2O55101 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syngr2O55101 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syngr2O55101 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syngr2O55101 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syngr2O55101 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syngr2O55101 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syngr2O55101 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syngr2O55101 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syngr2O55101 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syngr2O55101 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Syngr2O55101 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Syngr2O55101 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Syngr2O55101 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syngr2O55101 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syngr2O55101 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syngr2O55101 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syngr2O55101 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syngr2O55101 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syngr2O55101 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syngr2O55101 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syngr2O55101 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syngr2O55101 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syngr2O55101 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syngr2O55101 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syngr2O55101 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syngr2O55101 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syngr2O55101 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syngr2O55101 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syngr2O55101 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syngr2O55101 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syngr2O55101 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syngr2O55101 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syngr2O55101 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syngr2O55101 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syngr2O55101 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syngr2O55101 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syngr2O55101 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syngr2O55101 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syngr2O55101 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syngr2O55101 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syngr2O55101 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syngr2O55101 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syngr2O55101 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Syngr2O55101 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syngr2O55101 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syngr2O55101 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syngr2O55101 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syngr2O55101 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syngr2O55101 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syngr2O55101 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syngr2O55101 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syngr2O55101 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syngr2O55101 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Syngr2O55101 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Syngr2O55101 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Syngr2O55101 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Syngr2O55101 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms