Protein–RNA interactions for Protein: O54788

Dffb, DNA fragmentation factor subunit beta, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffbO54788 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DffbO54788 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DffbO54788 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DffbO54788 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DffbO54788 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DffbO54788 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DffbO54788 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DffbO54788 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DffbO54788 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DffbO54788 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DffbO54788 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DffbO54788 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
DffbO54788 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DffbO54788 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DffbO54788 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DffbO54788 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DffbO54788 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DffbO54788 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DffbO54788 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DffbO54788 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DffbO54788 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DffbO54788 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DffbO54788 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DffbO54788 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DffbO54788 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DffbO54788 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DffbO54788 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DffbO54788 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DffbO54788 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DffbO54788 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DffbO54788 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DffbO54788 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DffbO54788 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DffbO54788 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DffbO54788 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
DffbO54788 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DffbO54788 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DffbO54788 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DffbO54788 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DffbO54788 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DffbO54788 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DffbO54788 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DffbO54788 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DffbO54788 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DffbO54788 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DffbO54788 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DffbO54788 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DffbO54788 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DffbO54788 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DffbO54788 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DffbO54788 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
DffbO54788 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DffbO54788 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DffbO54788 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DffbO54788 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DffbO54788 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DffbO54788 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
DffbO54788 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DffbO54788 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
DffbO54788 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
DffbO54788 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DffbO54788 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DffbO54788 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
DffbO54788 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
DffbO54788 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DffbO54788 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DffbO54788 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DffbO54788 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DffbO54788 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DffbO54788 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DffbO54788 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DffbO54788 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DffbO54788 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DffbO54788 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DffbO54788 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DffbO54788 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DffbO54788 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DffbO54788 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DffbO54788 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
DffbO54788 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DffbO54788 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DffbO54788 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DffbO54788 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DffbO54788 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DffbO54788 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DffbO54788 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DffbO54788 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DffbO54788 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DffbO54788 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DffbO54788 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DffbO54788 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DffbO54788 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DffbO54788 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DffbO54788 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DffbO54788 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DffbO54788 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DffbO54788 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DffbO54788 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DffbO54788 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DffbO54788 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms