Protein–RNA interactions for Protein: O35711

Ppfibp2, Liprin-beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfibp2O35711 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Ppfibp2O35711 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ppfibp2O35711 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ppfibp2O35711 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ppfibp2O35711 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ppfibp2O35711 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ppfibp2O35711 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ppfibp2O35711 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ppfibp2O35711 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ppfibp2O35711 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Ppfibp2O35711 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ppfibp2O35711 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ppfibp2O35711 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ppfibp2O35711 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ppfibp2O35711 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ppfibp2O35711 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ppfibp2O35711 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ppfibp2O35711 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ppfibp2O35711 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ppfibp2O35711 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ppfibp2O35711 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ppfibp2O35711 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ppfibp2O35711 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ppfibp2O35711 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ppfibp2O35711 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ppfibp2O35711 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ppfibp2O35711 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ppfibp2O35711 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Ppfibp2O35711 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Ppfibp2O35711 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ppfibp2O35711 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ppfibp2O35711 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ppfibp2O35711 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ppfibp2O35711 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ppfibp2O35711 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ppfibp2O35711 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ppfibp2O35711 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Ppfibp2O35711 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ppfibp2O35711 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ppfibp2O35711 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ppfibp2O35711 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ppfibp2O35711 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Ppfibp2O35711 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ppfibp2O35711 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ppfibp2O35711 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Ppfibp2O35711 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ppfibp2O35711 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ppfibp2O35711 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ppfibp2O35711 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ppfibp2O35711 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ppfibp2O35711 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ppfibp2O35711 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ppfibp2O35711 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ppfibp2O35711 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ppfibp2O35711 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ppfibp2O35711 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ppfibp2O35711 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ppfibp2O35711 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ppfibp2O35711 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ppfibp2O35711 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ppfibp2O35711 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ppfibp2O35711 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ppfibp2O35711 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ppfibp2O35711 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ppfibp2O35711 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ppfibp2O35711 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Ppfibp2O35711 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ppfibp2O35711 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ppfibp2O35711 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Ppfibp2O35711 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Ppfibp2O35711 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ppfibp2O35711 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ppfibp2O35711 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ppfibp2O35711 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ppfibp2O35711 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ppfibp2O35711 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ppfibp2O35711 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ppfibp2O35711 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Ppfibp2O35711 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ppfibp2O35711 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ppfibp2O35711 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ppfibp2O35711 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ppfibp2O35711 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ppfibp2O35711 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ppfibp2O35711 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ppfibp2O35711 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ppfibp2O35711 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ppfibp2O35711 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ppfibp2O35711 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ppfibp2O35711 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ppfibp2O35711 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ppfibp2O35711 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ppfibp2O35711 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ppfibp2O35711 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ppfibp2O35711 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ppfibp2O35711 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ppfibp2O35711 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ppfibp2O35711 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ppfibp2O35711 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ppfibp2O35711 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms