Protein–RNA interactions for Protein: L7MU04

H2al1o, Histone H2A, mousemouse

Predictions only

Length 110 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1oL7MU04 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2al1oL7MU04 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2al1oL7MU04 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2al1oL7MU04 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2al1oL7MU04 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2al1oL7MU04 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2al1oL7MU04 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2al1oL7MU04 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2al1oL7MU04 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2al1oL7MU04 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2al1oL7MU04 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2al1oL7MU04 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2al1oL7MU04 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2al1oL7MU04 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2al1oL7MU04 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2al1oL7MU04 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2al1oL7MU04 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2al1oL7MU04 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2al1oL7MU04 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2al1oL7MU04 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
H2al1oL7MU04 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2al1oL7MU04 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2al1oL7MU04 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
H2al1oL7MU04 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2al1oL7MU04 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2al1oL7MU04 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2al1oL7MU04 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2al1oL7MU04 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2al1oL7MU04 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2al1oL7MU04 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2al1oL7MU04 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2al1oL7MU04 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2al1oL7MU04 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2al1oL7MU04 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2al1oL7MU04 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2al1oL7MU04 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2al1oL7MU04 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2al1oL7MU04 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2al1oL7MU04 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2al1oL7MU04 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
H2al1oL7MU04 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2al1oL7MU04 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2al1oL7MU04 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2al1oL7MU04 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
H2al1oL7MU04 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2al1oL7MU04 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2al1oL7MU04 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
H2al1oL7MU04 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2al1oL7MU04 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2al1oL7MU04 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2al1oL7MU04 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2al1oL7MU04 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2al1oL7MU04 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2al1oL7MU04 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2al1oL7MU04 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2al1oL7MU04 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2al1oL7MU04 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2al1oL7MU04 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2al1oL7MU04 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2al1oL7MU04 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2al1oL7MU04 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2al1oL7MU04 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2al1oL7MU04 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2al1oL7MU04 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2al1oL7MU04 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2al1oL7MU04 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2al1oL7MU04 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2al1oL7MU04 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2al1oL7MU04 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2al1oL7MU04 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2al1oL7MU04 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2al1oL7MU04 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
H2al1oL7MU04 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2al1oL7MU04 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2al1oL7MU04 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2al1oL7MU04 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2al1oL7MU04 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2al1oL7MU04 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2al1oL7MU04 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2al1oL7MU04 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2al1oL7MU04 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2al1oL7MU04 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2al1oL7MU04 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
H2al1oL7MU04 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2al1oL7MU04 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
H2al1oL7MU04 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
H2al1oL7MU04 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
H2al1oL7MU04 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
H2al1oL7MU04 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
H2al1oL7MU04 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
H2al1oL7MU04 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
H2al1oL7MU04 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
H2al1oL7MU04 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
H2al1oL7MU04 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
H2al1oL7MU04 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
H2al1oL7MU04 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
H2al1oL7MU04 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
H2al1oL7MU04 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
H2al1oL7MU04 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
H2al1oL7MU04 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms