Protein–RNA interactions for Protein: F6YKI2

Gm8220, Predicted gene 8220 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8220F6YKI2 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm8220F6YKI2 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm8220F6YKI2 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm8220F6YKI2 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm8220F6YKI2 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm8220F6YKI2 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm8220F6YKI2 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm8220F6YKI2 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm8220F6YKI2 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm8220F6YKI2 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm8220F6YKI2 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm8220F6YKI2 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm8220F6YKI2 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm8220F6YKI2 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm8220F6YKI2 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm8220F6YKI2 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm8220F6YKI2 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm8220F6YKI2 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm8220F6YKI2 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm8220F6YKI2 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm8220F6YKI2 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm8220F6YKI2 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm8220F6YKI2 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm8220F6YKI2 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm8220F6YKI2 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm8220F6YKI2 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm8220F6YKI2 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm8220F6YKI2 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm8220F6YKI2 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm8220F6YKI2 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm8220F6YKI2 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm8220F6YKI2 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm8220F6YKI2 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm8220F6YKI2 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm8220F6YKI2 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm8220F6YKI2 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm8220F6YKI2 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm8220F6YKI2 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm8220F6YKI2 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm8220F6YKI2 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm8220F6YKI2 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm8220F6YKI2 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm8220F6YKI2 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm8220F6YKI2 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm8220F6YKI2 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm8220F6YKI2 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm8220F6YKI2 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm8220F6YKI2 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm8220F6YKI2 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm8220F6YKI2 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm8220F6YKI2 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm8220F6YKI2 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm8220F6YKI2 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm8220F6YKI2 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm8220F6YKI2 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm8220F6YKI2 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm8220F6YKI2 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm8220F6YKI2 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm8220F6YKI2 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm8220F6YKI2 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm8220F6YKI2 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm8220F6YKI2 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm8220F6YKI2 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm8220F6YKI2 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm8220F6YKI2 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm8220F6YKI2 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm8220F6YKI2 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm8220F6YKI2 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm8220F6YKI2 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm8220F6YKI2 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm8220F6YKI2 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm8220F6YKI2 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm8220F6YKI2 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm8220F6YKI2 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm8220F6YKI2 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm8220F6YKI2 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm8220F6YKI2 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm8220F6YKI2 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm8220F6YKI2 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm8220F6YKI2 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm8220F6YKI2 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm8220F6YKI2 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm8220F6YKI2 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm8220F6YKI2 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm8220F6YKI2 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm8220F6YKI2 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm8220F6YKI2 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm8220F6YKI2 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm8220F6YKI2 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm8220F6YKI2 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm8220F6YKI2 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm8220F6YKI2 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm8220F6YKI2 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm8220F6YKI2 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm8220F6YKI2 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm8220F6YKI2 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm8220F6YKI2 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm8220F6YKI2 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm8220F6YKI2 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm8220F6YKI2 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms