Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6B2

Ccdc85c, Coiled-coil domain-containing protein 85C, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85cE9Q6B2 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc85cE9Q6B2 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc85cE9Q6B2 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc85cE9Q6B2 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc85cE9Q6B2 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc85cE9Q6B2 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc85cE9Q6B2 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc85cE9Q6B2 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ccdc85cE9Q6B2 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc85cE9Q6B2 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc85cE9Q6B2 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc85cE9Q6B2 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc85cE9Q6B2 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc85cE9Q6B2 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc85cE9Q6B2 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc85cE9Q6B2 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc85cE9Q6B2 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc85cE9Q6B2 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc85cE9Q6B2 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc85cE9Q6B2 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc85cE9Q6B2 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc85cE9Q6B2 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc85cE9Q6B2 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc85cE9Q6B2 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc85cE9Q6B2 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc85cE9Q6B2 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc85cE9Q6B2 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc85cE9Q6B2 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc85cE9Q6B2 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc85cE9Q6B2 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc85cE9Q6B2 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc85cE9Q6B2 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc85cE9Q6B2 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc85cE9Q6B2 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc85cE9Q6B2 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc85cE9Q6B2 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc85cE9Q6B2 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc85cE9Q6B2 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc85cE9Q6B2 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc85cE9Q6B2 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc85cE9Q6B2 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc85cE9Q6B2 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc85cE9Q6B2 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc85cE9Q6B2 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc85cE9Q6B2 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc85cE9Q6B2 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc85cE9Q6B2 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc85cE9Q6B2 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc85cE9Q6B2 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc85cE9Q6B2 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc85cE9Q6B2 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc85cE9Q6B2 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc85cE9Q6B2 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc85cE9Q6B2 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc85cE9Q6B2 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc85cE9Q6B2 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc85cE9Q6B2 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc85cE9Q6B2 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc85cE9Q6B2 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc85cE9Q6B2 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc85cE9Q6B2 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc85cE9Q6B2 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc85cE9Q6B2 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc85cE9Q6B2 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc85cE9Q6B2 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc85cE9Q6B2 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc85cE9Q6B2 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc85cE9Q6B2 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc85cE9Q6B2 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc85cE9Q6B2 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc85cE9Q6B2 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc85cE9Q6B2 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc85cE9Q6B2 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc85cE9Q6B2 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc85cE9Q6B2 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc85cE9Q6B2 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc85cE9Q6B2 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc85cE9Q6B2 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc85cE9Q6B2 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc85cE9Q6B2 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc85cE9Q6B2 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc85cE9Q6B2 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc85cE9Q6B2 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc85cE9Q6B2 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc85cE9Q6B2 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc85cE9Q6B2 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc85cE9Q6B2 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc85cE9Q6B2 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc85cE9Q6B2 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc85cE9Q6B2 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc85cE9Q6B2 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc85cE9Q6B2 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc85cE9Q6B2 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc85cE9Q6B2 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc85cE9Q6B2 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc85cE9Q6B2 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc85cE9Q6B2 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc85cE9Q6B2 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc85cE9Q6B2 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc85cE9Q6B2 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms